Springen naar inhoud

Theoretische opbrengst pcr


  • Log in om te kunnen reageren

#1

marie25

    marie25


  • 0 - 25 berichten
  • 4 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 15 maart 2010 - 13:11

Wij hebben een aantal vragen weet iemand hier het antwoord op?

1) Waarom wordt de opbrengst van een PCR geanalyseerd met agarose electroforese?
Het is toch veel simpeler om de geamplificeerde hoeveelheid DNA spectrofotometrisch te bepalen bij een golflengte van 280 nm (licht van die golflengte wordt specifiek door nucleotiden uitgedoofd).


2) Bereken de theoretische opbrengst van de PCR reactie als je een exponentieel verband tussen het aantal cycles en de concentratie van het geamplificeerde DNA-fragment aanneemt.


3) Bereken de theoretische opbrengst van de PCR reactie als je een lineair verband tussen het aantal cycles en de concentratie van het geamplificeerde DNA-fragment aanneemt.

Het aantal cycli dat we gedaan hebben is 25

bedankt!

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Wouter_Masselink

    Wouter_Masselink


  • >5k berichten
  • 8252 berichten
  • VIP

Geplaatst op 15 maart 2010 - 14:48

Betreffende de analyse van een PCR reactie, deze is zowel kwalitatief als kwantitatief te analyseren. Voor een kwalitatieve analyse kan je beter een agarose gel gebruiken terwijl je voor een kwantitatieve analyse beter een spectrofotometrische bepaling kan doen.

Verder is de theoretische opbrengst (in werkelijkheid een exponentieel verband) niet te bepalen als de input onbekend is. Waar loop je hier specifiek tegen problemen aan?

Verder verplaatst naar huiswerk
"Meep meep meep." Beaker

#3

marie25

    marie25


  • 0 - 25 berichten
  • 4 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 15 maart 2010 - 15:47

Betreffende de analyse van een PCR reactie, deze is zowel kwalitatief als kwantitatief te analyseren. Voor een kwalitatieve analyse kan je beter een agarose gel gebruiken terwijl je voor een kwantitatieve analyse beter een spectrofotometrische bepaling kan doen.

Verder is de theoretische opbrengst (in werkelijkheid een exponentieel verband) niet te bepalen als de input onbekend is. Waar loop je hier specifiek tegen problemen aan?

Verder verplaatst naar huiswerk


De eerste vraagis me al wat duidelijker

bij de tweede en derde vraag loop ik er tegen aan wat onze concentratie van het geamplificeerde DNA-fragment is

Veranderd door marie25, 15 maart 2010 - 15:48


#4

marie25

    marie25


  • 0 - 25 berichten
  • 4 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 15 maart 2010 - 18:12

De eerste vraagis me al wat duidelijker

bij de tweede en derde vraag loop ik er tegen aan wat onze concentratie van het geamplificeerde DNA-fragment is


heb nu bij de tweede vraag 2^25 = 33554432 DNA-fragementen

en bij de derde y=2x25+1 Y=51

kan dit?

#5

keijzer

    keijzer


  • 0 - 25 berichten
  • 7 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 23 maart 2010 - 13:57

op jou vraag 1: bij PCR wordt de opbrengst geanalyseerd met agarose electroforese omdat je hierbij met behulp van een marker kan bepalen hoeveel baseparen het DNA heeft

#6

WendyTje

    WendyTje


  • >250 berichten
  • 773 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 23 maart 2010 - 14:05

Zoals Wouter al zei kun je de eindconcentratie niet alleen bepalen met het aantal cycli, maar moet je ook weten wat de beginconcentratie was. Hoeveel (template) DNA heb je aan het begin in de reactie gestopt?
To boldly go where I`ve never been before

Be nice to nerds, chances are you`ll end up working for one





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures