Springen naar inhoud

P-waarde berekenen


  • Log in om te kunnen reageren

#1

sweetex

    sweetex


  • 0 - 25 berichten
  • 9 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 13 juni 2010 - 16:10

Beste mensen!

Ik ben bezig met een artikel te analyseren en ze beginnen te spreken over een berekende P-waarde, alleen weet ik niet hoe ze deze hebben berekend uit de volgende waardes:

IGF-I (ng/ml) 26 (= n) 369.9(=gemiddelde)  113.2 (+/- SD) 183.4 (medium) 386.3 (median) 637.8 (maximum)

De berekende P-waarde is 0,0051

Alvast bedankt ;)

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2


  • Gast

Geplaatst op 13 juni 2010 - 18:07

dat soort P-waarden betekent dat er een parametrische toets is losgelaten op de gevonden waarden van gemiddelde en standaardafwijking. Welke toets, dat hoort ofwel volgens conventie bekend te zijn, ofwel duidelijk te zijn uit de aard van de berekende waarde, ofwel genoemd te worden bij het geven van de P-waarde.

#3

sweetex

    sweetex


  • 0 - 25 berichten
  • 9 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 13 juni 2010 - 19:41

dat soort P-waarden betekent dat er een parametrische toets is losgelaten op de gevonden waarden van gemiddelde en standaardafwijking. Welke toets, dat hoort ofwel volgens conventie bekend te zijn, ofwel duidelijk te zijn uit de aard van de berekende waarde, ofwel genoemd te worden bij het geven van de P-waarde.


Geachte dat is nu juist mijn probleem! Van alle andere gegevens zeggen ze dat het niet-significant is maar ze geven er geen P-waardes bij. Nu moeten wij van die andere ook P-waardes berekenen, maar ik weet echt niet hoe dit gaat. De andere metingen zijn ook allemaal gegeven zoals in mijn voorbeeld...

#4


  • Gast

Geplaatst op 14 juni 2010 - 09:24

OK, tenzij iemand met ervaring in deze materie inspringt, zal ik proberen het samen met je uit te vinden, want zoveel toetsen zijn er nou ook weer niet. Bovendien ben ik ook altijd benieuwd geweest waarom deze P-waarden worden gegeven zonder te zeggen hoe ze zijn berekend.

Ik weet niet wat een IGF-waarde is, maar ik denk dat dat niet helemaal van belang is. Je krijgt enkele kengetallen en die kan ik invoeren in mijn TI-84 om mee te toetsen, misschbien heb jij ook zoiets. Ik moet alleen zien uit te vinden welke toets het is (kwestie van proberen) en hoeveel extra gegevens je dan nodig hebt.

#5

sweetex

    sweetex


  • 0 - 25 berichten
  • 9 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 14 juni 2010 - 11:06

OK, tenzij iemand met ervaring in deze materie inspringt, zal ik proberen het samen met je uit te vinden, want zoveel toetsen zijn er nou ook weer niet. Bovendien ben ik ook altijd benieuwd geweest waarom deze P-waarden worden gegeven zonder te zeggen hoe ze zijn berekend.

Ik weet niet wat een IGF-waarde is, maar ik denk dat dat niet helemaal van belang is. Je krijgt enkele kengetallen en die kan ik invoeren in mijn TI-84 om mee te toetsen, misschbien heb jij ook zoiets. Ik moet alleen zien uit te vinden welke toets het is (kwestie van proberen) en hoeveel extra gegevens je dan nodig hebt.


en als je gewoon een t-test toepast? Dan neem
je de mediaan als x en trek je van het gemiddelde die x af, deel je het door SD en verm je dit met de wortel van n...

#6

JWvdVeer

    JWvdVeer


  • >1k berichten
  • 1114 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 14 juni 2010 - 13:36

IGF1-waarde is Insulin-like Growth Factor 1. Het wordt in de medische wereld gebruikt voor onderzoek naar hoe veel groeihormoon je aanmaakt (dus voor groeistoornissen als acromegalie of groeihormoondeficiëntie), omdat het een veel lagere halfwaardetijd heeft dan groeihormoon zelf en de aanmaak er van door groeihormoon wordt gestimuleerd. Maar in zoverre het verhaal over IGF1.

TS: Als het mogelijk is kun je beter de volgende keer ook even de link naar het artikel meeposten.

en als je gewoon een t-test toepast?

De T-test is voor normaal verdeelde populaties en daarbij gaat het om het gemiddelde. Niet om de mediaan (die is enkel voor niet-normaal verdeelde populaties). Vrijwel biologische meetwaarden zijn normaal verdeeld, tenminste als het gaat om meetwaarden op interval- of rationiveau. Alleen kun je hebben dat dit niet het geval is wanneer je steekproef te klein is (n van 26 is niet zo heel groot).

IGF-I (ng/ml) 26 (= n) 369.9(=gemiddelde)  113.2 (+/- SD) 183.4 (medium) 386.3 (median) 637.8 (maximum)

Ik vraag me af of we hier iets zinnigs mee kunnen. Gezien het feit dat ze hier een standaarddeviatie neerzetten, lijkt het mij dat men uitgaat van een normaal-verdeelde steekproef. Alleen vraag ik me af wat wij met die andere waarden dan moeten. `Medium` ken ik niet als term in de statistiek. Ik ken enkel `minimum`, `mediaan` en `maximum`, met daarbij nog evt. de waarden van de 25e en 75e percentiel.

Ik vermoed dat men de P-waarde heeft verkregen uit de T-toets, Chi-kwadraattoets of Wilcoxon-toets heeft. Maar het is nog een beetje gokken, gezien ik totaal niet weet hoe het er uitziet. Overigens gaat het normaal om twee groepen met waarden. Nu hebben we hier maar één groep. Ze hebben het in elk geval niet enkel met die waarden die jij weergeeft berekend. Wellicht hebben ze het afgezet tegen de normaalwaarden of een controlegroep?

Veranderd door JWvdVeer, 14 juni 2010 - 13:37


#7

sweetex

    sweetex


  • 0 - 25 berichten
  • 9 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 14 juni 2010 - 18:17

IGF1-waarde is Insulin-like Growth Factor 1. Het wordt in de medische wereld gebruikt voor onderzoek naar hoe veel groeihormoon je aanmaakt (dus voor groeistoornissen als acromegalie of groeihormoondeficiëntie), omdat het een veel lagere halfwaardetijd heeft dan groeihormoon zelf en de aanmaak er van door groeihormoon wordt gestimuleerd. Maar in zoverre het verhaal over IGF1.

TS: Als het mogelijk is kun je beter de volgende keer ook even de link naar het artikel meeposten.

De T-test is voor normaal verdeelde populaties en daarbij gaat het om het gemiddelde. Niet om de mediaan (die is enkel voor niet-normaal verdeelde populaties). Vrijwel biologische meetwaarden zijn normaal verdeeld, tenminste als het gaat om meetwaarden op interval- of rationiveau. Alleen kun je hebben dat dit niet het geval is wanneer je steekproef te klein is (n van 26 is niet zo heel groot).

Ik vraag me af of we hier iets zinnigs mee kunnen. Gezien het feit dat ze hier een standaarddeviatie neerzetten, lijkt het mij dat men uitgaat van een normaal-verdeelde steekproef. Alleen vraag ik me af wat wij met die andere waarden dan moeten. `Medium` ken ik niet als term in de statistiek. Ik ken enkel `minimum`, `mediaan` en `maximum`, met daarbij nog evt. de waarden van de 25e en 75e percentiel.

Ik vermoed dat men de P-waarde heeft verkregen uit de T-toets, Chi-kwadraattoets of Wilcoxon-toets heeft. Maar het is nog een beetje gokken, gezien ik totaal niet weet hoe het er uitziet. Overigens gaat het normaal om twee groepen met waarden. Nu hebben we hier maar één groep. Ze hebben het in elk geval niet enkel met die waarden die jij weergeeft berekend. Wellicht hebben ze het afgezet tegen de normaalwaarden of een controlegroep?


Hej iedereen!

De pest is is dat het een betaald artikel is en dat ik de PDF niet kan uploaden (is te groot!).

#8

JWvdVeer

    JWvdVeer


  • >1k berichten
  • 1114 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 14 juni 2010 - 18:21

De pest is is dat het een betaald artikel is en dat ik de PDF niet kan uploaden (is te groot!).

Maak je een screendump van de desbetreffende pagina? Of je post de titel van het artikel hier, zodat we zelf evt. op pubmed of uptodate op kunnen zoeken?

#9

sweetex

    sweetex


  • 0 - 25 berichten
  • 9 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 14 juni 2010 - 19:44

Maak je een screendump van de desbetreffende pagina? Of je post de titel van het artikel hier, zodat we zelf evt. op pubmed of uptodate op kunnen zoeken?


De titel is: Predictor of Calcium Retention in Adolescent Boys

Auteur(s): K.Hill et al.

#10

Gesp

    Gesp


  • >250 berichten
  • 339 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 14 juni 2010 - 21:03

http://jcem.endojour...full/93/12/4743

The fitted nonlinear model for predicting Ca retention from dietary intake in boys (6) is shown in Fig. 1Go. Ca intake explained 21.7% (P = 0.0022) of the variation in Ca retention. Based on an examination of residual plots, serum IGF-I, IGFBP3, and testosterone were identified as candidate predictors for inclusion in the model. IGF-I was the best predictor and explained an additional 11.5% (P = 0.0051) of the variation. With IGF-I in the model, neither IGFBP3 nor testosterone was statistically significant.

Ik denk dat de p-waarde berekend wordt op basis van de R2. Oftewel: wat is de correlatie tussen Calcium-retentie (na correctie voor calcium intake) en IGF-1 concentratie. Lijkt me niet zo makkelijk na te rekenen.

#11

sweetex

    sweetex


  • 0 - 25 berichten
  • 9 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 15 juni 2010 - 14:41

http://jcem.endojour...full/93/12/4743
Ik denk dat de p-waarde berekend wordt op basis van de R2. Oftewel: wat is de correlatie tussen Calcium-retentie (na correctie voor calcium intake) en IGF-1 concentratie. Lijkt me niet zo makkelijk na te rekenen.


hmmm das rot:( ik heb de rest berekend met een t-test... Ook de igf-1 waarde en daar kwam ik een miniem verschil uit....

#12

JWvdVeer

    JWvdVeer


  • >1k berichten
  • 1114 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 15 juni 2010 - 15:10

hmmm das rot:( ik heb de rest berekend met een t-test... Ook de igf-1 waarde en daar kwam ik een miniem verschil uit....

Het voordeel voor je is dat r en t een verband met elkaar hebben dat wordt beschreven met de formule: LaTeX . Hij is niet helemaal exact, maar meestal kom je er wel een heel eind mee weg. Zie ook wikipedia.





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures