Ik heb een vraag over de volgende simulator voor populatiegenetica:
Simulator populatiegenetica
Deze simulator geeft de frequenties weer van twee allelelen (A1 en A2) in opeenvolgende generaties. De simulator stelt de gebruiker in staat verschillende voorwaarden op te leggen aan de simulatie. De gebruiker kan bijvoorbeeld de grootte van de populatie instellen of de fitness van een bepaald genotype verhogen of verlagen.
Concreet gaat mijn vraag over de invloed van de fitness van de genotypes op de drift van de allelen:
- we stellen de fitness van genotype A1A1, A1A2, A2A2 in op respectievelijk 1, 0.9, 0.9. Doordat genotype A1A1 een grotere fitness heeft, is het resultaat dat allel A1 snel gaat domineren over allel A2. Er is een grote drift. Allel A2 verdwijnt snel uit de populatie. Zie onderstaande figuur
- we stellen de fitness van genotype A1A1, A1A2, A2A2 in op respectievelijk 0.9, 0.9, 1. Doordat genotype A2A2 een grotere fitness heeft, is het resultaat dat allel A2 snel gaat domineren over allel A1. Er is een grote drift. Allel A1 verdwijnt snel uit de populatie. Zie onderstaande figuur
- we stellen de fitness van genotype A1A1, A1A2, A2A2 in op respectievelijk 0.9, 1, 0.9. Doordat genotype A1A2 beide allelen draagt, verwachten we niet dat een van beide allelen snel gaat domineren over de andere. We verwachten minder drift. Dat wordt bevestigd in onderstaande figuur
- we stellen de fitness van genotypes A1, A1A2, A2A2 nu in op respectievelijk 0.5, 1, 0.5. Net zoals in vorige situatie heeft A1A2 een grotere fitness. Dit genotype draagt echter beide allelen en we verwachten dus niet dat een van beide allelen snel gaat domineren over de andere. We verwachten evenveel drift als in vorige situatie. We zien echter dat er nog minder drift is dan in vorige situatie! Zie onderstaande figuur
Dit is toch een merkwaardig resultaat. Wanneer we Aa een veel grotere fitness toekennen dan AA en aa, is er amper drift. Wanneer we daarentegen AA en aa een veel grotere fitness toekennen dan Aa, is er heel veel drift. In dit laatste geval hebben beide allelen toch ook een even goede kans om doorgegeven te worden?
Bedankt voor uw tijd
