Springen naar inhoud

Blast parameters icm est sequenties


  • Log in om te kunnen reageren

#1

ZaphodBeeblebrox

    ZaphodBeeblebrox


  • 0 - 25 berichten
  • 1 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 18 februari 2011 - 14:43

Dit topic is naar aanleiding van een probleem die ik op mijn werk heb. Zelf wil ik EST sequenties BLASTen op genomisch DNA van tomaat (versie 2.40 is hier) te vinden. Welke instellingen van BLAST kan het beste hanteren? Het gaat overigens over tomaten ESTs. Dus het is binnen tomaat ;)

Genomisch DNA heeft 'last' van intronsequenties, die zitten niet in EST sequenties dus vandaar m'n vraag.

De sourcecode van de BLAST die ik gebruik is hier te vinden. Ik gebruik de windows 32 bits versie maar op de command line maakt dat niet uit.

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.




0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures