Dit topic is naar aanleiding van een probleem die ik op mijn werk heb. Zelf wil ik EST sequenties BLASTen op genomisch DNA van tomaat (versie 2.40 is hier) te vinden. Welke instellingen van BLAST kan het beste hanteren? Het gaat overigens over tomaten ESTs. Dus het is binnen tomaat
Genomisch DNA heeft 'last' van intronsequenties, die zitten niet in EST sequenties dus vandaar m'n vraag.
De sourcecode van de BLAST die ik gebruik is hier te vinden. Ik gebruik de windows 32 bits versie maar op de command line maakt dat niet uit.
Laatste berichten
- 08:29 Programmeren met vectoren 5
- 23:12 speciale rel. theorie 10
- 22:57 Straatklok loopt 5 minuten voor 11
- 22:57 wig 6
- 22:36 Gravity and gravitation 4
- 22:24 [scheikunde] vraag Chemie - wat is de oplossing? 10
- 19:47 Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 10
- 19:44 Vogels in de stad zijn goede klussers 2
- 19:12 Rood laserlicht 3
- 17:30 Herleiden afmetingen vanaf een foto 21
- 16:34 [wiskunde] Prijs Product per KG; Alternatief Inzicht 3
- 13:57 do-re-mi-fa-so vliegtuigen 9
- 13:16 geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 17
- 13:12 [natuurkunde] kroon van koning op Syracuse 10
- 25 apr 2013 – Augustus Vraag 3 3
- 24 apr Vraag 2009 Juli Vraag 5 5
- 24 apr positie 2
- 24 apr Schroefdraad berekening 8
- 24 apr [scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
- 23 apr Weerfrustratie 9
Nieuwsberichten
- 04 mar Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
- 31 okt AI kan via stem diabetes vaststellen 11
- 21 okt Einstein krijgt wéér gelijk 45
- 07 feb witter dan wit 20
- 19 jun irrigatie en de aardas