Dit topic is naar aanleiding van een probleem die ik op mijn werk heb. Zelf wil ik EST sequenties BLASTen op genomisch DNA van tomaat (versie 2.40 is hier) te vinden. Welke instellingen van BLAST kan het beste hanteren? Het gaat overigens over tomaten ESTs. Dus het is binnen tomaat
Genomisch DNA heeft 'last' van intronsequenties, die zitten niet in EST sequenties dus vandaar m'n vraag.
De sourcecode van de BLAST die ik gebruik is hier te vinden. Ik gebruik de windows 32 bits versie maar op de command line maakt dat niet uit.
Laatste berichten
- 13:36 geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 55
- 12:49 Python: fout in programma om strings te vergelijken 7
- 09:06 Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 19
- 01:11 is er een 5e dimensie nodig voor gekromde ruimte-tijd? 10
- 17:17 Aardlek-schakelaar 43
- 05 mei prijselasticiteit elektra 6
- 04 mei hoektoename 14
- 04 mei Sommatie reeks 3
- 04 mei positie 3
- 03 mei draadloze koptelefoon 2
- 03 mei toevallige ontmoeting 7
- 03 mei Straatklok loopt 5 minuten voor 18
- 03 mei Berekening (stuur)motor
- 03 mei Voynich manuscript ontcijferd? 2
- 02 mei Electric(al) 2
- 02 mei Gezocht: de/een naam voor een getallenrij met een cauchyrij als partieelsommenrij 1
- 02 mei Muon 2
- 01 mei veldsterkte 6
- 01 mei Schroefdraad berekening 9
- 30 apr kwikkolom 7
Nieuwsberichten
- 04 mar Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
- 31 okt AI kan via stem diabetes vaststellen 11
- 21 okt Einstein krijgt wéér gelijk 45
- 07 feb witter dan wit 20
- 19 jun irrigatie en de aardas