Springen naar inhoud

Primer


  • Log in om te kunnen reageren

#1

luckymagic

    luckymagic


  • 0 - 25 berichten
  • 18 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 02 april 2011 - 20:49

Hoe kun je weten welke primers er worden gebruikt? En tot welke producten leiden de primers?

Groeten,
Wendy

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Sjitty

    Sjitty


  • >250 berichten
  • 320 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 02 april 2011 - 22:29

Primers voor welke procedure? kun je wat meer situering geven over waar je de primers gebruikt of nodig hebt?

Om dit stukje DNA:

5'- ACTGACTGACTAGCGTAGCTACGGCTAGCTAGCTAG- 3'
3'- TGACTGACTGATCGCATCGATGCCGATCGATCGATC- 5'

te repliceren heb je 2 primers nodig, één voor elke enkelstreng complementair met een uiteinde van de enkelstreng maar wel in de juiste richting! DNA polymerase synthetiseert de complementaire streng altijd van 5' naar 3' en "leest"de template streng dus van 3' naar 5'.

Voor bovenste enkelstreng

5'- ACTGACTGACTAGCGTAGCTACGGCTAGCTAGCTAG- 3'

heb je volgende primer nodig (minsten ongeveer 10 nucleotiden lang):

3' -TAGCTAGCTAG- 5' ( de juiste notatie voor DNA sequenties is normaal van 5' naar 3' maar hier even niet voor de duidelijkheid)

om volgend construct te hebben

5'- ACTGACTGACTAGCGTAGCTACGGCTAGCTAGCTAG- 3'
___________________________3' -TCGATCGATC- 5'

die kan gerepliceerd worden door DNA polymerase in de 5' => 3' richting

Voor de onderste enkelstreng

3'- TGACTGACTGATCGCATCGATGCCGATCGATCGATC- 5'

heb je een tweede primer nodig

5' -ACTGACTGAC- 3'

om volgend construct te hebben

5' -ACTGACTGAC- 3'___________________________
3'- TGACTGACTGATCGCATCGATGCCGATCGATCGATC- 5'

die kan gerepliceerd worden door DNA polymerase in de 5' => 3' richting

Om vooraf te weten welke primers je nodig hebt om een bepaald DNA fragment te repliceren moet je de sequentie kennen van dat stukje, alhoewel random primers ook gebruikt worden in sommige analyses.
Om achteraf te weten welke primers gebruikt werden moet je dus de sequentie van de verkregen DNA sequenties weten

Veranderd door Sjitty, 02 april 2011 - 22:30


#3

polyergus

    polyergus


  • 0 - 25 berichten
  • 1 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 09 mei 2012 - 10:05

Om vooraf te weten welke primers je nodig hebt om een bepaald DNA fragment te repliceren moet je de sequentie kennen van dat stukje, alhoewel random primers ook gebruikt worden in sommige analyses.


Dit heb ik mij al dikwijls afgevraagd. Vooraleer een geschikte primer kan worden gemaakt, moet de onderzoeker weten welke sequentie er dient gezocht te worden. Hoe wordt de te zoeken sequentie bepaald? Als men dit eenmaal weet, hoe wordt dan een primer gemaakt. Ik kan mij moeilijk voorstellen dat alle ingrediënten worden gemengd op hoop van zegen. Hoe bepaalt men hierbij trouwens de juiste 5' - 3' richting?

#4

Mrtn

    Mrtn


  • >1k berichten
  • 4220 berichten
  • VIP

Geplaatst op 09 mei 2012 - 11:47

Primers voor PCR neem ik aan? De synthese kan je gewoon vinden op bijvoorbeeld wiki
Het ontwerpen van een primer kan op bijvoorbeeld ncbi
Of course, the theory of relativity only works if you're going west.
-Calvin-





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures