bivalente ion-DNA interacties
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 13
bivalente ion-DNA interacties
Wat is de rol, indien bestaand, van MgCl2 in een PCR reactie naast de relatie met het Mg2+ dependency van het Taq-polymerase ?
Klopt mijn vermoeden van een DNA-conformatieinteractie met twee waardige ionen in oplossing, resulterende in een verstarring van de templatebackbone...?
Jorim: Gebruik sub- en superscript aub! Bekijk de [url=http://help functie hoe sub- en superscript te gebruiken
Klopt mijn vermoeden van een DNA-conformatieinteractie met twee waardige ionen in oplossing, resulterende in een verstarring van de templatebackbone...?
Jorim: Gebruik sub- en superscript aub! Bekijk de [url=http://help functie hoe sub- en superscript te gebruiken
-
- Berichten: 337
Re: bivalente ion-DNA interacties
Hallo Spanko! Welkom op Chemieforum.nl!
Mg2+ (opgelost als MgCl2) heeft naast rol als cofactor van Taq-polymerase inderdaad een backbone stabiliserende werking . Een hoge [MgCl2] verhoogt de opbrengst, maar verlaagt de specificiteit:
Mg2+ (opgelost als MgCl2) heeft naast rol als cofactor van Taq-polymerase inderdaad een backbone stabiliserende werking . Een hoge [MgCl2] verhoogt de opbrengst, maar verlaagt de specificiteit:
en de echte verklaring:The success of amplification requires optimal Mg2+ concentrations. The result of changing the Mg2+ concentration in only a narrow range can be quite striking. In general, higher Mg2+ concentrations increase the PCR yield but decrease the specificity of the reaction and favor the formation of primer-dimers; lower Mg2+ concentrations increase the specificity, but decrease the yield.
PS. zet je Chemielevel maar wat hoger (6)Mg2+ is critical for binding phosphate groups in nucleic acids (reduces the repelling action of negatively charged phosphates, and allows chain folding to occur). Mg2+ is needed for maintaining an adequate supply of purine and pyrimidine nucleotides required for DNA/RNA synthesis (cell proliferation).
- Berichten: 2.330
Re: bivalente ion-DNA interacties
Site met nog meer info over Magnesiumchloride bij PCR
Misschien heb je hier ook nog wat aan.
Ik sluit me trouwens helemaal aan bij de verklaring van Gideon
MvG Ron
Misschien heb je hier ook nog wat aan.
Ik sluit me trouwens helemaal aan bij de verklaring van Gideon
MvG Ron
-
- Berichten: 13
Re: bivalente ion-DNA interacties
Dit is de informatie die ik zocht. Bedankt voor de snelle en kundige reactie.