bivalente ion-DNA interacties

Moderator: ArcherBarry

Reageer
Berichten: 13

bivalente ion-DNA interacties

Wat is de rol, indien bestaand, van MgCl2 in een PCR reactie naast de relatie met het Mg2+ dependency van het Taq-polymerase ?

Klopt mijn vermoeden van een DNA-conformatieinteractie met twee waardige ionen in oplossing, resulterende in een verstarring van de templatebackbone...?

Jorim: Gebruik sub- en superscript aub! Bekijk de [url=http://help functie hoe sub- en superscript te gebruiken

Berichten: 337

Re: bivalente ion-DNA interacties

Hallo Spanko! Welkom op Chemieforum.nl! :cry:

Mg2+ (opgelost als MgCl2) heeft naast rol als cofactor van Taq-polymerase inderdaad een backbone stabiliserende werking :D . Een hoge [MgCl2] verhoogt de opbrengst, maar verlaagt de specificiteit:
The success of amplification requires optimal Mg2+ concentrations. The result of changing the Mg2+ concentration in only a narrow range can be quite striking. In general, higher Mg2+ concentrations increase the PCR yield but decrease the specificity of the reaction and favor the formation of primer-dimers; lower Mg2+ concentrations increase the specificity, but decrease the yield.
en de echte verklaring:
Mg2+ is critical for binding phosphate groups in nucleic acids (reduces the repelling action of negatively charged phosphates, and allows chain folding to occur). Mg2+ is needed for maintaining an adequate supply of purine and pyrimidine nucleotides required for DNA/RNA synthesis (cell proliferation).
PS. zet je Chemielevel maar wat hoger (6) :P

Gebruikersavatar
Berichten: 2.330

Re: bivalente ion-DNA interacties

Site met nog meer info over Magnesiumchloride bij PCR

Misschien heb je hier ook nog wat aan.

Ik sluit me trouwens helemaal aan bij de verklaring van Gideon :cry:

MvG Ron

Berichten: 13

Re: bivalente ion-DNA interacties

Dit is de informatie die ik zocht. Bedankt voor de snelle en kundige reactie.

Reageer