Springen naar inhoud

eiwitten


  • Log in om te kunnen reageren

#1

mlo-ertje

    mlo-ertje


  • 0 - 25 berichten
  • 14 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 18 februari 2005 - 12:41

ik ben op zoek naar de verschillende eiwit samenstellingen.
een voorbeeld myoglobulin, dit is een eiwit, maar er moet toch bekend zijn welke aminozuren dit eiwit vormen?

ik ben al 2 dagen fulltime aan het zoeken en heb alleen insuline gevonden in Strayer.

wie helpt mij aan een leuke website?
:)

Veranderd door mlo-ertje, 18 februari 2005 - 12:42


Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

JeroenCV

    JeroenCV


  • >1k berichten
  • 1153 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 18 februari 2005 - 13:03

je hebt verschillende databasen op het web die je de sequencen van eiwitten vertellen.
Twee daarvan zijn:

expasy: vul in het zoekveld je eiwit (engelse naam) in

je krijgt een lijst met alles waar de naam in voor komt. Zoek dan het juiste organisme (voor myoglobin, meestal "horse heart"). Klik en je bent er.

Een verder handleinding vind je on-line bij de link die hierboven staat.

entrez Pubmed vul in het zoekveld je eiwit in, zeg dat je een protein zoekt (via dat tab blaadje)


Verder heb je Profound, Mascot...er is genoeg te vinden als je weet waar te zoeken.

Veranderd door JeroenC, 18 februari 2005 - 13:06


#3

Beryllium

    Beryllium


  • >5k berichten
  • 6314 berichten
  • Minicursusauteur

Geplaatst op 18 februari 2005 - 13:32

Misschien dat het een handig idee is om een lijstje van deze websites over te nemen in onze weblinks? Heeft iemand toevallig een uitgebreide lijst van deze sites?
You can't possibly be a scientist if you mind people thinking that you're a fool. (Douglas Adams)

#4

JeroenCV

    JeroenCV


  • >1k berichten
  • 1153 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 18 februari 2005 - 13:41

nou deze twee kan je zeker neerzetten.

Verder worden dit soort wewbsites veel gebruikt in de "proteomics"
Dan heb je bv. een digestie uitgevoerd en bepaald met LC-MS/MS en vult je gevonden massa's (van de gevormde peptiden) en sequencen in. Deze websites geven dan de mogelijke eiwitten. Helaas moet je vaak voor deze websites een soort licentie hebben, anders zie je door de bomen het bos niet meer. (er staan nu ongeveer 15000000 sequencen en die wil je echt niet allemaal doorzoeken) Door een licentie verklein je de zoekvelden. bv. je koopt een licentie "mamals" of "bacteria"

kortom. met deze twee links vind je de eiwitten, maar wil je meer dan heb je andere websites nodig.

#5

rwwh

    rwwh


  • >5k berichten
  • 6847 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 18 februari 2005 - 21:36

Het "Sequence Retrieval System" (SRS) van Thure Etzold (een oud collega van me) is een web-applicatie die een heel netwerk aan databanken aan elkaar koppelt. Dat gaat om eiwitvolgordes, DNA segmenten, 3D structuren, en van alles ertussenin.

Zie bijvoorbeeld:
http://srs.ebi.ac.uk...rsq2 -noSession





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures