Pagina 1 van 1

DNA

Geplaatst: ma 12 sep 2005, 17:03
door McSnarf
LS.

Een DNA molecuul bestaat uit 2 strengen die (in tegengestelde richting) om elkaar heen draaien, zodat er een rechtsdraaiende dubbele helix ontstaat.

Nu is mijn vraag: deze helix kan ook linksdraaien zijn. Wat voor invloed heeft dat op de eigenschappen van het DNA molecuul, wat voor eigenschappen veranderen er dan.

(kortom: wat is het verschil tussen links en rechtsdraaiende DNA moleculen)

Vriendelijke groet,

Frans

Re: DNA

Geplaatst: ma 12 sep 2005, 19:39
door rwwh
McSnarf schreef: Een DNA molecuul bestaat uit 2 strengen die (in tegengestelde richting) om elkaar heen draaien, zodat er een rechtsdraaiende dubbele helix ontstaat.
Nope, om een rechtsdraaiende helix te maken draaien allebei de strengen rechtsom. Probeer maar eens met twee stukjes koperdraad waarvan 1 een linkse en 1 een rechtse draai heeft een combinatie te maken. En plantjes die om elkaar heen draaien draaien ook altijd dezelfde kant op.

Een linksdraaiende helix heeft dus twee strengen nodig die allebei andersom draaien. Daarvoor is een heel grote conformatieverandering nodig.

Ik heb wel eens gehoord dat dit onder zekere condities kan gebeuren. Toen ik dat voor het eerst hoorde dacht men dat het iets te maken kon hebben met het aflezen van de volgorde: in de linkse helix zijn de basen meer aan het oppervlak.

Re: DNA

Geplaatst: ma 12 sep 2005, 21:28
door sdekivit
het zorgt voor een verschil in de major en de minor groove van het DNA molecuul. Zoek daar eens op. Ook kun je zoeken op Z-DNA.

Re: DNA

Geplaatst: di 13 sep 2005, 00:05
door McSnarf
Z dna ken ik, en ook die grooves ken ik. Het grote verschil tussen deze twee kwam ter sprake tijdens het biochemie college: de clou onthield de docent ons echter nog...

Met tegengesteld bedoelde ik eerder het 3'5' vs 5'3' richting..

Nog meer ideeen?

Groetjes,

Frans

Re: DNA

Geplaatst: di 13 sep 2005, 00:54
door DrQuico
Vanwege de chiraliteit van de D-deoxyribose eenheden in DNA krijg je enkel de rechtsdraaiende helix gevormd. Voor de linksdraaiende helix zul je DNA met de andere stereoisomeer van deoxyribose (L-Deoxyribose) moeten maken. In de natuur komt enkel de D-vorm voor.

De fysische eigenschappen zullen voor beide helixen gelijk zijn, maar hoogstwaarschijnlijk zal de linksdraaiende helix geen enkele biochemische activiteit vertonen in normale organismen. Immers natuurlijke enzymen zijn ook chiraal (enkel linksdraaiend ditmaal) waardoor bij een niet-natuurlijke linksdraaiende DNA helix de boel niet meer past (sleutel-slot principe).

De vraag waardoor/waarom alle aminozuren linksdraaiend zijn en deoxyribose rechtsdraaiend is ligt in de origine van het ontstaan van het leven op aarde. Over dit onderwerp is in de wetenschappelijke wereld (en daarbuiten) nog geen concensus ontstaan.

Re: DNA

Geplaatst: di 13 sep 2005, 17:57
door rwwh
Natuurlijk is de chiraliteit van de suikers en de basen uiteindelijk verantwoordelijk voor de voorkeursrichting van de spiraal. Maar, DrQuico, dat neemt niet weg dat zelfs rechtsdraaiend ribose door omstandigheden (hoge zoutconcentratie) ertoe kan worden bewogen een linkshandige helix te vormen....

Re: DNA

Geplaatst: di 13 sep 2005, 19:21
door Gideon
Maar, DrQuico, dat neemt niet weg dat zelfs rechtsdraaiend ribose door omstandigheden (hoge zoutconcentratie) ertoe kan worden bewogen een linkshandige helix te vormen...


Dit is toch helemaal niet relevant? [-X

Re: DNA

Geplaatst: di 13 sep 2005, 20:44
door rwwh
Maar, DrQuico, dat neemt niet weg dat zelfs rechtsdraaiend ribose door omstandigheden (hoge zoutconcentratie) ertoe kan worden bewogen een linkshandige helix te vormen...


Dit is toch helemaal niet relevant? [-X
Interessante kijk, maar volgens mijn lezing was dat toch echt de vraag.

Re: DNA

Geplaatst: di 13 sep 2005, 22:57
door DrQuico
Natuurlijk is de chiraliteit van de suikers en de basen uiteindelijk verantwoordelijk voor de voorkeursrichting van de spiraal. Maar, DrQuico, dat neemt niet weg dat zelfs rechtsdraaiend ribose door omstandigheden (hoge zoutconcentratie) ertoe kan worden bewogen een linkshandige helix te vormen....
Is dat zo? Dat wist ik niet. [-X

Re: DNA

Geplaatst: wo 14 sep 2005, 10:22
door Gideon
maar volgens mijn lezing was dat toch echt de vraag


Ahum... je hebt helemaal gelijk... Afbeelding

Ik misinterpreteerde de vraag [-X