hai allemaal
ik heb een vraagje waar ik niet uit kan komen.
komende week heb ik practica en daarvoor moet ik vragen beantwoorden.
practicum gaat over het cloneren van een repressor gen van bacteriofaag lambda.
de vraag:
T.b.v. een ligatie-reactie wordt een insert : vector ratio gebruikt van 3 : 1 mol. Het insert is 750 bp groot en de vector 5100 bp. Voor de ligatie wordt 100 ng vector DNA gebruikt. Berekenen de hoeveelheid (ng) insert DNA dat nodig is voor de ligatie onder de hierboven genoemde omstandigheden en ga hierbij vanuit dat het gemiddelde molecuulgewicht van een nucleotide 325 g/mol is.
ik hoop dat iemand mij hierbij kan helpen.
en nog 1 klein vraagje....
digestie van DNA door een restrictie enzym is eventueel BSA nodig. Wat bepaalt of je wel of geen BSA gebruikt? Wat doet BSA?
bij voorbaat dank
Laatste berichten
-
08:29
Programmeren met vectoren 5
-
23:12
speciale rel. theorie 10
-
22:57
Straatklok loopt 5 minuten voor 11
-
22:57
wig 6
-
22:36
Gravity and gravitation 4
-
22:24
[scheikunde] vraag Chemie - wat is de oplossing? 10
-
19:47
Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 10
-
19:44
Vogels in de stad zijn goede klussers 2
-
19:12
Rood laserlicht 3
-
17:30
Herleiden afmetingen vanaf een foto 21
-
16:34
[wiskunde] Prijs Product per KG; Alternatief Inzicht 3
-
13:57
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 9
-
13:16
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 17
-
13:12
[natuurkunde] kroon van koning op Syracuse 10
-
25 apr
2013 – Augustus Vraag 3 3
-
24 apr
Vraag 2009 Juli Vraag 5 5
-
24 apr
positie 2
-
24 apr
Schroefdraad berekening 8
-
24 apr
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
-
23 apr
Weerfrustratie 9
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
berekening vector : insert
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 337
Re: berekening vector : insert
Ik help je een handje, het kant-en-klare antwoord geef ik liever niet.
Het is als volgt. Je gegeven is dat je 100 ng vector DNA hebt, dit staat gelijk aan 100*E-9 g. Omdat je de molmassa van een nucleotide weet, weet je ook de molmassa van de vector (5100 bp x 325 g/mol x 2 strengen).
Als je het aantal gram van je vector deelt door de molmassa ervan, krijg je het aantal molen als antwoord. Je weet nu ook dat je 3x dit aantal molen van je insert moet toevoegen in je ligatiereactie, om erachter te komen hoeveel grammen dit is moet je weer hier naar terugrekenen.
(hoe je dit doet valt denk ik nu wel te beredeneren)
Succes!
Het is als volgt. Je gegeven is dat je 100 ng vector DNA hebt, dit staat gelijk aan 100*E-9 g. Omdat je de molmassa van een nucleotide weet, weet je ook de molmassa van de vector (5100 bp x 325 g/mol x 2 strengen).
Als je het aantal gram van je vector deelt door de molmassa ervan, krijg je het aantal molen als antwoord. Je weet nu ook dat je 3x dit aantal molen van je insert moet toevoegen in je ligatiereactie, om erachter te komen hoeveel grammen dit is moet je weer hier naar terugrekenen.
(hoe je dit doet valt denk ik nu wel te beredeneren)
Succes!
-
- Berichten: 2
Re: berekening vector : insert
toppie dank je, geloof dat ik er nu uit ben
hopen dat het klopt wat ik heb gedaan [-X
hopen dat het klopt wat ik heb gedaan [-X
-
- Berichten: 1
Re: berekening vector : insert
Hoi,
Is die ratio insert/vector eigenlijk altijd 3:1 mol? Momenteel voer ik vaak ligaties uit, maar ik heb altijd een probleem met het inschatten van die verhouding.
Groetjes,
Is die ratio insert/vector eigenlijk altijd 3:1 mol? Momenteel voer ik vaak ligaties uit, maar ik heb altijd een probleem met het inschatten van die verhouding.
Groetjes,
-
- Berichten: 740
Re: berekening vector : insert
Gewoon ng/ul
Bij een grote insert pak je lage ratio zoals 1:1, 1:2 en soms 1:3
bij een kleine insert pak je een hoge ratio zoals soms wel 1:10
Meestal moet je door optimaliseren uitvinden wat je beste ratio is door te varieren.
Ligeren blijft altijd lastig, ik heb er ook vaak problemen mee, maar ik werk ook met inserts van 4000 en 5000 bp...
Bij een grote insert pak je lage ratio zoals 1:1, 1:2 en soms 1:3
bij een kleine insert pak je een hoge ratio zoals soms wel 1:10
Meestal moet je door optimaliseren uitvinden wat je beste ratio is door te varieren.
Ligeren blijft altijd lastig, ik heb er ook vaak problemen mee, maar ik werk ook met inserts van 4000 en 5000 bp...
