weet iemand waarom men na de cycle sequencing het DNA staal moet zuiveren (=purificeren)??
Als iemand nog illustraties of afbeeldingen heeft van ABI 3730 DNA analyzer....laat maar komen!
alvast mijn dank
(overigens mijn beste wensen voor 2006)
seth
Gideon: Ik heb het onderwerp voor de goede orde even verplaatst.
Laatste berichten
-
18:53
Ik wil studeren via afstandsonderwijs, kennen jullie Tech?
-
18:51
Herleiden afmetingen vanaf een foto 5
-
18:09
Rotatie van het heelal 32
-
17:19
Ervaringen met "herontdekkingen" 12
-
21:28
hall effect in vloeistof gebruiken als stromingssensor 6
-
18 apr
Gezocht: de/een naam voor een getallenrij met een cauchyrij als partieelsommenrij
-
18 apr
Casus uit de praktijk: positief test THC 18
-
17 apr
speciale rel. theorie 4
-
17 apr
Vreemde stank in huis 11
-
17 apr
3 vragen over mijn rooskleurige r.berekening H2netGekoppeldeHBrflowbatterij.
-
17 apr
Interpretatie reactie-energie 3
-
17 apr
Logistic equation (Pierre Verhulst,Belgian Mathematician) 5
-
16 apr
vB 9
-
15 apr
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 1
-
15 apr
Python: sockets sluiten 4
-
14 apr
Een eenvoudige logische redenering waarom tijd niet kan bestaan 'daarbuiten' 6
-
14 apr
Hoe kun je op quantumwijze getallen vinden in een rij die kleiner zijn dan getal k 3
-
13 apr
Documentenverdwijnen uit onedrive 1
-
12 apr
Behoud van impulsmoment en energie 5
-
12 apr
INLOG STORING / TIPS 4
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
capillaire sequencer
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 2.035
Re: capillaire sequencer
Van het zuiveren weet ik niet genoeg.... wat ik WEL kan is Googlen op 'ABI 3730 DNA analyzer'... als je zoekt op plaatjes vind je 10 hits :eusa_sick:
Jij ook de beste wensen!
Jij ook de beste wensen!
-
- Berichten: 61
Re: capillaire sequencer
kheb de reden al gevonden!
maar ik zoek ook een artikel i.v.m. de capillaire sequencer
een wetenschappelijk artikel over genetische afwijkingen
kan iemand me helpen??
SETH
maar ik zoek ook een artikel i.v.m. de capillaire sequencer
een wetenschappelijk artikel over genetische afwijkingen
kan iemand me helpen??
SETH
-
- Berichten: 740
Re: capillaire sequencer
Ik heb al wat meerdere cycle sequencing reacties gedaan.
Als de BigDye terminator v1.1 of 3.1 gebruikt, dan moet je zuiveren om de achterbleven (niet gehechte) ddNTP's, dNTP's en primers te verwijderen.
Als je dit niet doet krijg je door de ddNTP's Dyeblobs in de je gel image.
(Zeer fel fluoriserende stukken) Hierdoor kun je ongeveer 5 basen niet aflezen.
Primers kunnen ook de analyse verstoren (dubbele lijnen in je image).
De zuivering kan je uitvoeren in 3 manieren:"
- Ethanol + Natriumacetaat zuivering (Voordeel: heel goedkoop nadeel: hierdoor kunnen de kleine stukjes DNA ook verdwijnen en het duurt lang)
- Ethanol + EDTA zuivering (Voordeel: heel goedkoopnadeel: soms blijven er primers achter, en duurt lang)
- Gel filtratie zuivering (Voordeel: snel en weinig handelingen, nadeel: Duur, bij v3.1 nog een extra handeling nodig)
- Magnetische beads zuivering (Voordeel: snel, weinig handelingen, nadeel: heeeel duur)
Zelf kies ik altijd voor de natrium acetaat zuivering, en ik hoor dat de meeste universiteiten deze methode ook gebruiken.
Als je nog meer info nodig hebt danb hoor ik het wel!
Als de BigDye terminator v1.1 of 3.1 gebruikt, dan moet je zuiveren om de achterbleven (niet gehechte) ddNTP's, dNTP's en primers te verwijderen.
Als je dit niet doet krijg je door de ddNTP's Dyeblobs in de je gel image.
(Zeer fel fluoriserende stukken) Hierdoor kun je ongeveer 5 basen niet aflezen.
Primers kunnen ook de analyse verstoren (dubbele lijnen in je image).
De zuivering kan je uitvoeren in 3 manieren:"
- Ethanol + Natriumacetaat zuivering (Voordeel: heel goedkoop nadeel: hierdoor kunnen de kleine stukjes DNA ook verdwijnen en het duurt lang)
- Ethanol + EDTA zuivering (Voordeel: heel goedkoopnadeel: soms blijven er primers achter, en duurt lang)
- Gel filtratie zuivering (Voordeel: snel en weinig handelingen, nadeel: Duur, bij v3.1 nog een extra handeling nodig)
- Magnetische beads zuivering (Voordeel: snel, weinig handelingen, nadeel: heeeel duur)
Zelf kies ik altijd voor de natrium acetaat zuivering, en ik hoor dat de meeste universiteiten deze methode ook gebruiken.
Als je nog meer info nodig hebt danb hoor ik het wel!
-
- Berichten: 740
Re: capillaire sequencer
Nog 1 ding: De zuiveringen voor een capilaire analyse (bv. ABI 3110) en een gel analyse
(ABI 377) zijn hetzelfde!
(ABI 377) zijn hetzelfde!
-
- Berichten: 740
Re: capillaire sequencer
Nog een vraag: Krijgen leerlingen van het middelbaar onderwijs ook al de theorie achter de sequentie analyse volgens Sanger???
Volgens mij is dit wat hoog gegrepen...
Volgens mij is dit wat hoog gegrepen...
-
- Berichten: 61
Re: capillaire sequencer
Weet u soms ook een artikel staan op het internet dat een toepassing bevat van een capillaire sequencer???
vb: opsporen microbiële infectie
opsporen genetische afwijking
met veel dank!!
seth
vb: opsporen microbiële infectie
opsporen genetische afwijking
met veel dank!!
seth
-
- Berichten: 740
Re: capillaire sequencer
Dit is een interactieve site die ik zelf wel leuk vind. Hier moet je via een sequentie analyse achterhalen welke bacterie soort de veroorzaker is van een bepaalde ziekte. Alle stappen komen hier goed aan bod.
http://www.hhmi.org/biointeractive/vlabs/index.html
Druk hier op de link The bacterial identification lab.
http://users.ugent.be/~avierstr/principles/seq.html
Hier staat nog wat meer theorie over de sequentie analyse.
http://www.hhmi.org/biointeractive/vlabs/index.html
Druk hier op de link The bacterial identification lab.
http://users.ugent.be/~avierstr/principles/seq.html
Hier staat nog wat meer theorie over de sequentie analyse.
