Springen naar inhoud

Biochemie


  • Log in om te kunnen reageren

#1

marloes

    marloes


  • >25 berichten
  • 26 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 16:09

Hey,
Ik hoop dat ik hier ook een biochemie vraagje mag stellen, of dat jullie mij anders kunnen zeggen waar ik hulp kan krijgen.

We zijn nu net met biochemie begonnen en ik ben bezig met een weekopdracht. Ik loop echter compleet vast, mijn boeken helpen me niet, zelfs het heilige google niet.

Ik ben opzoek naar informatie over het eiwit tPA, en dan vooral de 3d structuur.
Verder moet ik weten hoe een eiwit kan worden geisoleerd, gezuiverd en kan worden over gebracht in een prokaryotische productie cel zodat deze het eiwit gaat produceren.

Ik vraag niet zozeer om de antwoorden, maar ik hoop dat iemand mij een tip kan geven hoe ik hier naar kan zoeken. Misschien een naam van een isolatiemethode ofzo, of een handige site?

Bedankt alvast :)
m.v.g. marloes

Gideon: Ik heb hem even verplaatst naar de biochemie hoek...

Veranderd door Gideon, 01 februari 2006 - 16:22

Bij gebrek aan beter: .

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Jurn

    Jurn


  • >250 berichten
  • 851 berichten
  • VIP

Geplaatst op 01 februari 2006 - 16:28

Vragen mag altijd :)


Structuur (via google afbeeldingen)
Geplaatste afbeelding

En het mooie aan google afbeeldingen; hij geeft je even de link van de originele site

Kan je daar wat mee?

Veranderd door Jurn, 01 februari 2006 - 16:29

Jurn [WSF - Technicus]

It is better to be silent and be thought a fool, than to speak and remove all doubt -- Abraham Lincoln
Duct tape is like the force. It has a light side, a dark side, and it holds the universe together.... - Carl Zwanzig

#3

Gideon

    Gideon


  • Chemiefoum.nl erelid
  • 337 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 16:28

Je wilt dus iets doen met het eiwit tissue plasminogen activator.
Volgens mij ben je van plan tPA tot overexpressie te brengen in bacterieen, klopt dit?

Het is niet zo, zoals jij veronderstelt, dat wanneer je een eiwit isoleert, zuivert en overbrengt in een prokaryote cel (E. Coli bijvoorbeeld) dat deze dan het eiwit gaat maken. Eerder is het denk ik de bedoeling, dat je het DNA dat codeert voor tPA isoleert of amplificeert, daarna via een klonering zorgt dat de bacterie dit eiwit gaat maken.

Ik neem aan dat je pas daarna je eiwit moet isoleren en zuiveren...

Veranderd door Gideon, 01 februari 2006 - 16:29


#4

y500

    y500


  • >25 berichten
  • 31 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 16:28

Hoi Marrel

tPA, oftewel 'tissue plasminogen activator'... Gewoon via je heilige Google :) (structure "tissue plasminogen activator")

Voor de rest zou ik het (nog) niet weten :P

#5

marloes

    marloes


  • >25 berichten
  • 26 berichten
  • Gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 16:45

@Jurn
Mja die had ik inderdaad ook gevonden, er waren alleen meer foto's met andere structuren waardoor ik eigenlijk niet goed wist of dat de goede was.

@Gideon
Ehm ja ik denk dat ik dat wil :P. Het is een theorie opdracht, we moesten meer opzoeken over tPA en over hoe je eiwitten kon overbrengen in bacteriŽn. Dat overbrengen, isoleren etc. hoeft niet specefiek over tPA te gaan.
En wat je daarna zegt, ik geloof het meteen :) ik snapte het geheel ook nog niet helemaal.

@y500
Dankjewel, maar dat is geen 3D structuur :P
Bij gebrek aan beter: .

#6

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 16:55

Echte eiwit-3D structuren vind je (o.a.) in de Protein Data Bank.

Zoekend op "tpa" vind je hier 18 hits... daar zal degene die jij nodig hebt wel tussen zitten!

Per record in deze database vind je een heleboel relevante informatie over het desb. eiwit! :)

#7

y500

    y500


  • >25 berichten
  • 31 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 18:10

Hey Dhr Verheij,
Heeft U nog meer van zulke databanken in uw favorieten staan? Enzymen bijvoorbeeld, of chemicalien?
Alvast bedankt!

#8

Roy van Heesbeen

    Roy van Heesbeen


  • >250 berichten
  • 740 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 februari 2006 - 22:08

Met het overbrengen van een eiwit in E.coli komen een hoop dingen kijken. Als je bijvoorbeeld een eiwit hebt dat in mensen speciaal moet worden gevouwd in het golgi syteem, dan kan je dit eiwit niet ter expressie brengen in prokayrotische cellen (bevatten geen golgisysteem).

Om het eiwit te plaatsen in bacterie cellen moet je de sequentie van het eiwit vermenigvuldigen met moleculaire biologische technieken zoals PCR. Daarna kan je deze sequentie plaatsen in de cloning site van een bepaalde plasmide en deze kan je vervolgens transfecteren in een bacterie, om zo vervolgens je eiwit aan te maken. De controle kan je doen door het aantonen van je eiwit met technieken zoals Elisa enz.

#9

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 02 februari 2006 - 10:48

Hey Dhr Verheij,
Heeft U nog meer van zulke databanken in uw favorieten staan? Enzymen bijvoorbeeld, of chemicalien?
Alvast bedankt!

Eh ja, een stuk of 300 :)

Als je even aangeeft wat je precies zoekt, zal ik je een lijstje opsturen Geplaatste afbeelding

#10

Roy van Heesbeen

    Roy van Heesbeen


  • >250 berichten
  • 740 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 02 februari 2006 - 21:59

Ook wat in de richting moleculaire biologie, biochemie immunologie?

#11

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 03 februari 2006 - 15:00

Ik maak even een lijstje, en meel het aan jullie beiden :)

#12

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 04 februari 2006 - 09:50

Aangezien een van jullie twee geen email-adres heeft opgegeven, zet ik hem maar hier! :)

#13

y500

    y500


  • >25 berichten
  • 31 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 04 februari 2006 - 13:35

Wow,
Daar moeten er genoeg tussen zitten die bruikbaar zijn voor mijn studie!
Dank U!

#14

Roy van Heesbeen

    Roy van Heesbeen


  • >250 berichten
  • 740 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 05 februari 2006 - 13:46

dank je wel Herman! :)





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures