Springen naar inhoud

Fmoc- of Boc-groep synthese


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Fuzzwood

    Fuzzwood


  • >5k berichten
  • 11101 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 21 maart 2006 - 18:15

Ik zit me nu al 2 dagen rot te zoeken naar een fatsoenlijk synthesevoorschrift om een boc- of fmoc-groep aan een aminozuur te hechten. Zou iemand me aan een voorschrift kunnen helpen? :lol:

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

DrQuico

    DrQuico


  • >1k berichten
  • 2952 berichten
  • VIP

Geplaatst op 21 maart 2006 - 19:20

Uitgaande van Boc of Fmoc anhydride kun je de groepen op de volgende manieren aan een amine koppelen:

In waterige oplossing (erg geschikt voor aminozuren):
Substraat (1 eq) en NaOH (1.05 eq) oplossen in water. Bij kamertemperatuur Boc anhydride (1 eq) toevoegen en roeren bij kamertemperatuur. De reactieduur is afhankelijk van het amine (1-16 h). Je kunt de reactie volgen mbv TLC. Bij volledige conversie zuur je de oplossing voorzichtig (!) aan met een 5% citroenzuuroplossing. Je product slaat neer of je kunt het extraheren met ethyl acetaat. (Wanneer je de oplossing te sterk aanzuurt vliegt de groep er zo weer af)

In organische oplosmiddelen (voor niet wateroplosbare verbindingen):
Voeg aan een oplossing (dioxaan, DMF, aceton of THF) van het substraat (1 eq) 5 equivalenten K2CO3 toe. Voeg hier de Boc anhydride (1 eq) bij kamertemperatuur aan toe. Wanneer de conversie traag is kun je besluiten de boel enigzins te verwarmen. Bij volledige conversie wordt de suspensie gefiltreerd over Celite of een fijn filter en wordt het filtraat ingedampt.

Bij beide methodes kun je enigzins variŽren in de equivalenten. Bij een goedkoop aminozuur kun je hier een overmaat van gebruiken. Hierdoor reageert al het Boc anhydride weg waardoor je dit niet achteraf meer uit je product hoeft te halen. Bij een duur (of zelf gesynthetiseerd) amine kun je een overmaat Boc anhydride gebruiken. Je amine reageert dan volledig, maar je moet de overmaat wel weer verwijderen.
Het is ook altijd mogelijk om tijdens de reactie nog extra aminozuur of Boc anhydride toe te voegen mocht de conversie laag zijn of zeer traag verlopen.

#3

Fuzzwood

    Fuzzwood


  • >5k berichten
  • 11101 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 21 maart 2006 - 20:11

Uitgaande van Boc of Fmoc anhydride kun je de groepen op de volgende manieren aan een amine koppelen:

In waterige oplossing (erg geschikt voor aminozuren):
Substraat (1 eq) en NaOH (1.05 eq) oplossen in water. Bij kamertemperatuur Boc anhydride (1 eq) toevoegen en roeren bij kamertemperatuur. De reactieduur is afhankelijk van het amine (1-16 h). Je kunt de reactie volgen mbv TLC. Bij volledige conversie zuur je de oplossing voorzichtig (!) aan met een 5% citroenzuuroplossing. Je product slaat neer of je kunt het extraheren met ethyl acetaat. (Wanneer je de oplossing te sterk aanzuurt vliegt de groep er zo weer af)

In organische oplosmiddelen (voor niet wateroplosbare verbindingen):
Voeg aan een oplossing (dioxaan, DMF, aceton of THF) van het substraat (1 eq) 5 equivalenten K2CO3 toe. Voeg hier de Boc anhydride (1 eq) bij kamertemperatuur aan toe. Wanneer de conversie traag is kun je besluiten de boel enigzins te verwarmen. Bij volledige conversie wordt de suspensie gefiltreerd over Celite of een fijn filter en wordt het filtraat ingedampt.

Bij beide methodes kun je enigzins variŽren in de equivalenten. Bij een goedkoop aminozuur kun je hier een overmaat van gebruiken. Hierdoor reageert al het Boc anhydride weg waardoor je dit niet achteraf meer uit je product hoeft te halen. Bij een duur (of zelf gesynthetiseerd) amine kun je een overmaat Boc anhydride gebruiken. Je amine reageert dan volledig, maar je moet de overmaat wel weer verwijderen.
Het is ook altijd mogelijk om tijdens de reactie nog extra aminozuur of Boc anhydride toe te voegen mocht de conversie laag zijn of zeer traag verlopen.

Weet je toevallig hoe dit bij glycine en arginine zit?

#4

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 21 maart 2006 - 23:14

Ze zijn beide goed wateroplosbaar, dus methode 1 zal werken.... zeker voor glycine, arginine hangt het ervan af welk amine je wilt beschermen.... pKa is 9.0 voor het hoofd-keten amine, en 12.5 voor het R-groep amine, dus daar zal je bij de reactie rekening mee moeten houden :lol:

#5

Fuzzwood

    Fuzzwood


  • >5k berichten
  • 11101 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 21 maart 2006 - 23:36

Heej bedankt voor die tip. Dus als ik het goed begrijp moet de pH 8.5 zijn wil ik de hoofdketenamine beschermen en pH 12.5 voor de R-groepamine? Dus als de pH nooit boven de, zeg maar, 9 komt zal de R-groepamine nooit beschermd worden en boven de 12.5 dus beide? Of gebeurt er dan weer iets waardoor de hoofdketenamine niet beschermd wordt?

EDIT: hier stond een lap tekst maar na een nachtje slapen was dit niet meer nodig :lol:

Voor referentie is dit Z-(D)-Arg-Gly-Arg-pNA.HCl.

Veranderd door FsWd, 22 maart 2006 - 07:25


#6

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 22 maart 2006 - 09:43

Heej bedankt voor die tip. Dus als ik het goed begrijp moet de pH 8.5 zijn wil ik de hoofdketenamine beschermen en pH 12.5 voor de R-groepamine? Dus als de pH nooit boven de, zeg maar, 9 komt zal de R-groepamine nooit beschermd worden en boven de 12.5 dus beide? Of gebeurt er dan weer iets waardoor de hoofdketenamine niet beschermd wordt?


Het is misschien nog ingewikkelder dan dat.... de reactie gebeurt aan het vrije amine, maar of en wat er gebeurt als deze aanwezig is als NH3+-groep weet ik niet... misschien dat Quico hier kan helpen? :lol:

Ter referentie: Arginine bij verschillende pH's:

Geplaatste afbeelding

edit: plaatje geschaald ;)

Veranderd door The Herminator, 22 maart 2006 - 09:44






0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures