Springen naar inhoud

Massa spectrum


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Jeroen_CF

    Jeroen_CF


  • >25 berichten
  • 91 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 14:23

Hallo vraagje:

Op school heb ik altijd geleerd dat een ms spectrum uit verticale lijnen bestaat, maar ik zie ook plaatjes van ms spectra's die uit pieken bestaan.

Voorbeeld

Wat ik niet snap is dat de massa van een fragment dus blijkbaar een gauss-verdeling heeft. Maar een fragment heeft toch maar 1 massa ?

Ik bedoel dat een CH3 groep altijd een massa van : 12.011+(3*1.007825 ) heeft en dus op die massa maar een verticale lijn geeft en geen piek.

Kunnen jullie mij verder helpen,

Alvast bedankt,

Jeroen.
What we do in life echoes in eternity

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Fuzzwood

    Fuzzwood


  • >5k berichten
  • 11101 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 30 april 2006 - 14:39

Heb je al aan de isotoopverhoudingen gedacht? Er bestaat ook 13-koolstof en deuterium ;)

#3

Jeroen_CF

    Jeroen_CF


  • >25 berichten
  • 91 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 16:19

Ja maar die komen in verhouding veel minder voor. Ik heb het meer over een piek met een resolustie van een 1/2 Da breed.

Plaatje

Hier zie je een fragment met massapieken met een hoge resolutie. Volgens mij ook meerdere isotopen van het fragment.

Maar je ziet hiet pieken met een verdeling en geen verticale lijnen.

Veranderd door Jeroen, 30 april 2006 - 16:38

What we do in life echoes in eternity

#4

Napoleon1981

    Napoleon1981


  • >1k berichten
  • 2399 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 17:21

Dat heeft te maken met de resolutie van je massa spectrometer. De software kan vaak staafjes weergeven of deze gaussian pieken. De staafjes suggereren oneindighooge resulutie, iets wat niet waar is.

#5

Jeroen_CF

    Jeroen_CF


  • >25 berichten
  • 91 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 17:26

nee maar wat is die resolutie?? is dat de fout in het spectum ofzo want een CH3 heeft voor mij nog steeds een massa van 15.03482 of 16.03482 (C13 isotoop). en niet een massa tussen de 14.53482 tot 15.53482 ( CH3 met C12).

Veranderd door Jeroen, 30 april 2006 - 17:27

What we do in life echoes in eternity

#6

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 18:16

Dat al die m/z waardes eindigen op 0.5 zijn is inderdaad zeer "verdacht".... waar komt dit spectrum vandaan?

De weergave van staafjes danwel anderssoortige pieken is inderdaad (zoals Jeroen al zei) een kwestie van apparaat-instelling.....

#7

Jeroen_CF

    Jeroen_CF


  • >25 berichten
  • 91 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 18:55

Link van plaatje

Mijn vraag is voornamelijk met het plaatje als voorbeeld hoe het kan dat een fragment met een vaste massa een piek met een verdeling kan geven.
What we do in life echoes in eternity

#8

rwwh

    rwwh


  • >5k berichten
  • 6847 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 30 april 2006 - 18:58

De piekbreedte is een combinatie van een variatie in de te meten waarde en een variatie in het meetapparaat. Als je de lengte van de premier meet met het meetapparaat "schatting door een Nederlander" dan is de variatie in de te meten waarde heel klein, maar de variatie in de meting heel groot.

Als je een slechte massaspectrometer hebt, dan bepaalt deze de massa van het ion de ene keer als 14,8 , en de volgende keer als 15,2. Dit komt niet omdat de massas van de ionen verschillend zijn, maar omdat de massabepaling niet zo goed is.

Ga maar eens 3 keer achtereen op een personenweegschaal staan.... Je eigen massa verandert ook geen halve kilogram binnen een minuut....

#9

Napoleon1981

    Napoleon1981


  • >1k berichten
  • 2399 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 19:05

Juist en als je het nog meer als 3x gaat doen, kom je uit op een gaussian distribution rond het gemiddelde. 0.5 massa units is trouwens zeer zeer normaal voor instrumenten als ion-traps en quadrupoles.

#10

Jeroen_CF

    Jeroen_CF


  • >25 berichten
  • 91 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 19:08

Kijk dat is nou precies wat ik wilde weten ;)

Jammer dat ze dit op school nooit hebben verteld en ons steeds voor de gek hebben gehouden met mooie rechte lijnen in de spectra's :P

Bedankt voor de uitleg.
What we do in life echoes in eternity

#11

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 20:36

Je bent niet "voor de gek gehouden", men laat alleen maar voor de duidelijkheid de zaken wat scherper zien dan ze misschien zijn.... er zijn overigens zat massa-spectrometers die inderdaad vlijmscherpe pieken kunnen geven! ;)

#12

Napoleon1981

    Napoleon1981


  • >1k berichten
  • 2399 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 30 april 2006 - 22:12

Wanneer je precies gaat kijken zijn ook deze pieken gaussian distributions. De massa spectrometer die paaltjes geeft moet nog uitgevonden worden. Als je deze kunt uitvinden ben je trouwens rijk ;).

Het is trouwens een spelletje bij massa-spectroscopie, je kunt scannen over een groter gebied en resolutie verliezen, of maar een paar ionen volgen en het apparaat fine tunen op deze ionen en wat resolutie winnen.

Veranderd door Napoleon1981, 30 april 2006 - 22:15


#13

JeroenCV

    JeroenCV


  • >1k berichten
  • 1153 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 07:06

Het is trouwens een spelletje bij massa-spectroscopie, je kunt scannen over een groter gebied en resolutie verliezen, of maar een paar ionen volgen en het apparaat fine tunen op deze ionen en wat resolutie winnen.

en welke je wilt doen, hangt af van je doel. ;)

#14

eric van der meulen

    eric van der meulen


  • >25 berichten
  • 67 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 26 juli 2007 - 01:02

MS pieken hebben altijd een gaussich voorkomen. Dit komt door onder andere een verdeling in kinetische energie tussen ionen van dezelfde massa. Door de beperkingen van computers in de 60'er en 70''er jaren is besloten om van massaspectra alleen de top van de piek weer te geven. Dit is de reden dat dat in een massaspectrum vaak alleen een "lijntje" wordt weergegeven. Een kwestie van voorzichtig omgaan met computergeheugen en opslagcapaciteit. Tegenwoordig wordt dit nog steeds gedaan en we spreken dan van ''centroid mass'': het is nu een soort traditie geworden. In moderne massaspectrometers kunnen ook de volledige datafiles worden opgeslagen als ''profile spectra''. Dit wordt vaak gedaan bij het analyseren van grote moleculen zoals peptiden. Bij kleine moleculen is het nog steeds goed gebruik om centroid mass spectra te hanteren.





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures