Springen naar inhoud

Verschil tussen biotine en photobiotine


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Astridje85_CF

    Astridje85_CF


  • >25 berichten
  • 67 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 07:54

Weet iemand het verschil tussen biotine en photobiotine qua binding aan het nucleinezuur en structuurformules.

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 09:26

Ik heb nog nooit gehoord van "photobiotine", en Google geeft welgeteld 6 hits... meestal een teken dat er iets niet klopt.... wat is het precies?

#3

Astridje85_CF

    Astridje85_CF


  • >25 berichten
  • 67 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 11:37

photobiotine is een aryl azide afgeleide van biotine, welke je d.m.v. chemische reacties kunt binden aan DNA (i.p.v. dat je PCR gebruikt).
de gehele procedure zorgt echter voor zeer veel DNA verlies en daarom willen we dus biotine chemisch binden aan het DNA. Echter wordt 'gewone' biotine gebonden d.m.v. PCR reacties (dUTP enz.) en dat is nou juist iets wat we niet willen doen.
verder wordt photobiotine ook afgebroken door licht, iets waar we ook helemaal niet zo gelukkig mee zijn.

#4

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 12:18

Duidelijk.... echter, tenzij je de chemische formule kan laten zien, wordt het denk ik moeilijk voor niet-ingewijden (zoals ik) om uitspraken over het reactiemechanisme te kunnen doen ;)

#5

Napoleon1981

    Napoleon1981


  • >1k berichten
  • 2399 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 14:25

photobiotine heeft ook voordelen hoor. Wanneer je een light cleavable label gebruikt zul je geen last meer hebben van het label in de verdere analise. Ik ben geen biochemicus, maar in de bio-analytische toepassing wordt biotine vaak gebruikt in affinity chromatography, denk maar aan de quantitave proteomics toepassing van Rudi Aebersolt. De biotine wordt daar verwijderd door de reductie van een zwavel-zwavel verbinding, maar licht is natuurlijk een andere oplossing. Zeker in de massa spectroscopie en de data base searches in de proteomics wil je niet een groot molecuul met zijn eigen fragmentaties introduceren.

#6

Astridje85_CF

    Astridje85_CF


  • >25 berichten
  • 67 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 14:48

Bij deze de structuurformule!

Geplaatste afbeelding

#7

Astridje85_CF

    Astridje85_CF


  • >25 berichten
  • 67 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 14:49

photobiotine heeft ook voordelen hoor. Wanneer je een light cleavable label gebruikt zul je geen last meer hebben van het label in de verdere analise. Ik ben geen biochemicus, maar in de bio-analytische toepassing wordt biotine vaak gebruikt in affinity chromatography, denk maar aan de quantitave proteomics toepassing van Rudi Aebersolt. De biotine wordt daar verwijderd door de reductie van een zwavel-zwavel verbinding, maar licht is natuurlijk een andere oplossing. Zeker in de massa spectroscopie en de data base searches in de proteomics wil je niet een groot molecuul met zijn eigen fragmentaties introduceren.

Eerlijk gezegd gaat mij dit een beetje boven mijn pet (ben ook geen biochemicus, maar een simpele microbiologisch analist); maar ik begrijp dat dit op eiwitten van toepassing is, en daar werk ik niet mee.

#8

The Herminator

    The Herminator


  • >1k berichten
  • 2035 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 01 mei 2006 - 15:49

Mooie kleurtjes! ;)

Ik zal morgenochtend meteen kijken wat ik kan vinden m.b.t. de verschillen in binding tussen biotine en photobiotine!





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures