ik heb een vraag, over de sequencer
hoe word deze ingesteld, wat zijn de controles, wanneer moet een bepaling overnieuw?
alvast bedankt
Laatste berichten
-
22:27
positie 1
-
21:34
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 8
-
21:15
Weerfrustratie 9
-
18:24
Schroefdraad berekening 5
-
18:08
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 15
-
14:16
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 7
-
14:16
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 3
-
13:57
De Euro Nederlandse 100 qubit computer komt eraan
-
10:42
projectiel 8
-
10:37
Verschil tussen deze 2 vragen 5
-
09:25
[scheikunde] berekeningen labo vitamine c bepaling 1
-
22 apr
[wiskunde] rode en witte ballen verdelen 8
-
22 apr
Rotatie van het heelal 41
-
22 apr
Muntje opgooien 14
-
21 apr
Reactiviteit silyl enol ethers 1
-
21 apr
Criterium voor vochtretentie
-
21 apr
speciale rel. theorie 5
-
21 apr
Vogels in de stad zijn goede klussers
-
21 apr
Ervaringen met "herontdekkingen" 15
-
20 apr
Herleiden afmetingen vanaf een foto 19
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
Sequencer
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 740
Re: Sequencer
Die vraag kan je niet zomaar beantwoorden.
De instellingen liggen volledig aan het construct wat gesequenced wordt.
Bijvoorbeeld welke sequence kit er is gebruikt (meestal BigDye terminator van AB v1.1 of 3.1).
Wat voor sequencer gebruik je? Een oude PAGE sequencer werkt geheel anders dan een nieuwe capilaire sequencer.
Controles: bij de meeste kits krijg je pGEM erbij met een bijbehorende primer.
In de handleiding staat de sequentie van deze plasmide. Deze kan je vergelijken.
Als deze niet overeenkomt, moet je reactie opnieuw.
Een reactie moet overnieuw als je een slechte alligment hebt, of als er veel mutaties voorkomen. Om dit te beoordelen moet je een goed programma gebruiken (ik gebruik SECentral en CodonCode aligner) en kijken naar de kwaliteit van je basenpaar calling.
De instellingen liggen volledig aan het construct wat gesequenced wordt.
Bijvoorbeeld welke sequence kit er is gebruikt (meestal BigDye terminator van AB v1.1 of 3.1).
Wat voor sequencer gebruik je? Een oude PAGE sequencer werkt geheel anders dan een nieuwe capilaire sequencer.
Controles: bij de meeste kits krijg je pGEM erbij met een bijbehorende primer.
In de handleiding staat de sequentie van deze plasmide. Deze kan je vergelijken.
Als deze niet overeenkomt, moet je reactie opnieuw.
Een reactie moet overnieuw als je een slechte alligment hebt, of als er veel mutaties voorkomen. Om dit te beoordelen moet je een goed programma gebruiken (ik gebruik SECentral en CodonCode aligner) en kijken naar de kwaliteit van je basenpaar calling.
-
- Berichten: 3
Re: Sequencer
thx roy voor je uitleg, hier kan ik al iets meer mee
op je vraag "Wat voor sequencer gebruik je?" heb ik het volgende antwoord
Het is een capilaire sequencer en de sequence kit die gebruikt wordt op mn stage plek is de AB v3.1
op je vraag "Wat voor sequencer gebruik je?" heb ik het volgende antwoord
Het is een capilaire sequencer en de sequence kit die gebruikt wordt op mn stage plek is de AB v3.1
-
- Berichten: 740
Re: Sequencer
De instellingen liggen nu aan de lengte van jou construct (zal wel lang zijn aangezien je v3.1 gebruikt).
Dit moet je goed invoeren bij je sequence software. Daarnaast moet je het gebruikte polymeer (POP) goed instellen.
Hoe het precies zit weet ik niet meer, het is voor mij al een tijd geleden dat ik zelf heb gesequenced. We hebben hier voor een mooi geautomatiseerd lab
Dit moet je goed invoeren bij je sequence software. Daarnaast moet je het gebruikte polymeer (POP) goed instellen.
Hoe het precies zit weet ik niet meer, het is voor mij al een tijd geleden dat ik zelf heb gesequenced. We hebben hier voor een mooi geautomatiseerd lab
-
- Berichten: 1
Re: Sequencer
Hey JR,
Kennelijk worden me posts verwijderd als ik iets persoonlijks schrijf dus bij deze:
Applied Biosystems 3130
http://www.michaelsmith.ubc.ca/services/NA...gment_Analysis/
n00b
mzls
Kennelijk worden me posts verwijderd als ik iets persoonlijks schrijf dus bij deze:
Applied Biosystems 3130
http://www.michaelsmith.ubc.ca/services/NA...gment_Analysis/
n00b
mzls
-
- Berichten: 11.177
Re: Sequencer
Mja je moet mensen niet liggen uitschelden...dat noemen ze fatsoensnormen...
