Hallo!
Ik vind protein mass fingerprinting en sequence tagging nogal moeilijk: wat ik ervan begrijp is dit:
1. Bij peptide mass fingerprinting behandel je een eiwit met trypsine, welke achter lysine (K) en arginine ® knip en dus krijg je allemaal peptides die eindigen met een K of R.
2. Hiervan neem je een MS spectrum, dan kun je de volgorde van grootte bepalen.
3. Vervolgens vergelijk je de verkregen peptide map (met de peptide stukjes op grootte gerangschikt) met een database waarbij men theoretisch de stukjes eiwit met trypsine heeft behandeld
4. Je vind een eiwit wat overeenkomt
Sequence tagging gebruik je om deze eiwitkeuze te bevestigen.
Maar ga je bij sequence tagging nu van alle peptide stukjes de sequentie bepalen (en dus de sequentie van het hele eiwit)?
Hoop dat iemand me kan helpen!
Groetjes!
Laatste berichten
-
16:45
wig 8
-
15:56
Programmeren met vectoren 6
-
14:53
Straatklok loopt 5 minuten voor 12
-
23:12
speciale rel. theorie 10
-
22:36
Gravity and gravitation 4
-
22:24
[scheikunde] vraag Chemie - wat is de oplossing? 10
-
19:47
Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 10
-
19:44
Vogels in de stad zijn goede klussers 2
-
19:12
Rood laserlicht 3
-
17:30
Herleiden afmetingen vanaf een foto 21
-
25 apr
[wiskunde] Prijs Product per KG; Alternatief Inzicht 3
-
25 apr
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 9
-
25 apr
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 17
-
25 apr
[natuurkunde] kroon van koning op Syracuse 10
-
25 apr
2013 – Augustus Vraag 3 3
-
24 apr
Vraag 2009 Juli Vraag 5 5
-
24 apr
positie 2
-
24 apr
Schroefdraad berekening 8
-
24 apr
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
-
23 apr
Weerfrustratie 9
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
[scheikunde] Sequence tagging / protein mass fingerprinting
Moderators: ArcherBarry, Fuzzwood
-
- Berichten: 560
Re: [scheikunde] Sequence tagging / protein mass fingerprinting
Ik zou even zoeken op de term eiwitidentificatie met behulp van MALDI-TOF-MS. Ik heb hier een artikel over moeten schrijven voor mijn opleiding.
Ik had hier hele mooie bronnen voor. Hierin beschrijven ze een aantal van je vragen. Als ik ze thuis nog heb zal ik ze online zetten en de link hier even posten.
Maar ik kan je al een stukje op weg helpen. Men heeft bepaalde databasses waarin gnomen van eiwitten beschreven staan. De stukjes waarin een eiwit wordt opgeknipt kan men dus opzoeken in deze database waardoor ze uiteindelijk het totale eiwit kunnen identificeren.
Aangezien men MS gebruikt kunnen alle stukjes snel en tegelijk worden geanalyseerd. Dus inprincipe doet men dit van elke sequence....dat moet ik alleen dus even opzoeken!
To be continued.....
Ik had hier hele mooie bronnen voor. Hierin beschrijven ze een aantal van je vragen. Als ik ze thuis nog heb zal ik ze online zetten en de link hier even posten.
Maar ik kan je al een stukje op weg helpen. Men heeft bepaalde databasses waarin gnomen van eiwitten beschreven staan. De stukjes waarin een eiwit wordt opgeknipt kan men dus opzoeken in deze database waardoor ze uiteindelijk het totale eiwit kunnen identificeren.
Aangezien men MS gebruikt kunnen alle stukjes snel en tegelijk worden geanalyseerd. Dus inprincipe doet men dit van elke sequence....dat moet ik alleen dus even opzoeken!
To be continued.....
-
- Berichten: 125
Re: [scheikunde] Sequence tagging / protein mass fingerprinting
Hallo,
Kijk ook eens hier op wikipedia...
http://en.wikipedia.org/wiki/Peptide_mass_fingerprinting
sjouke
Kijk ook eens hier op wikipedia...
http://en.wikipedia.org/wiki/Peptide_mass_fingerprinting
sjouke
