Springen naar inhoud

Primers bij PCR


  • Log in om te kunnen reageren

#1

pjennick

    pjennick


  • 0 - 25 berichten
  • 1 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 23 maart 2009 - 15:10

Hallo,

Wij moeten een eiwit (in ons geval Tumor Necrosis Factor) recombinant aanmaken.
We moeten tot in detail beschrijven welke stappen we volgen en wat we allemaal ondernemen om dit te bereiken.

Eén van onze stappen is PCR om te controleren of onze vector het insert bevat.
(kunnen jullie nog volgen??)
Om dit te doen hebben we 2 primers nodig , als startplaats voor de amplificatie.

Nu is onze vraag: waar vinden we deze primers?

Greetzz
PJ en Nick (en Hannes)

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Liesje87

    Liesje87


  • 0 - 25 berichten
  • 3 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 23 maart 2009 - 21:14

Primers kan je ontwikkelen met software programma's zoals Primer3 Input 0.4.0 (Vind je snel via google)
Je moet enkele waardes ingeven waaraan je primers moeten voldoen zoals grootte, Tm, GC%, zelf-complariteit en product grootte (dit zijn de belangrijkse parameters). De meeste van deze waardes zijn automatisch ingevuld en hoef je meestal maar in kleine mate te veranderen... Op het internet vind je wel informatie over deze eigenschappen van primers.

Om een goed primerpaar te vinden, kijk je op de output naar de E-waarde, deze waarde geeft aan hoe slecht de primer met het desbetreffende gen bindt. E moet dus zo laag mogelijk zijn voor het gen dat je wil amplificeren, en zo hoog mogelijk (>1) voor de andere (gelijkaardige) genen die op de outputlijst vermeld worden.





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures