Dag iedereen,
Op het chromatogram dat je verkrijgt na sequencing PCR staan pieken van verschillende grootte.
Mag ik hieruit besluiten, hoe groter de piek hoe meer fragmenten aanwezig waren die met dat welbepaalde nucleotide beëindigd waren? Of is dit geen juist verband?
Laatste berichten
-
08:29
Programmeren met vectoren 5
-
23:12
speciale rel. theorie 10
-
22:57
Straatklok loopt 5 minuten voor 11
-
22:57
wig 6
-
22:36
Gravity and gravitation 4
-
22:24
[scheikunde] vraag Chemie - wat is de oplossing? 10
-
19:47
Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 10
-
19:44
Vogels in de stad zijn goede klussers 2
-
19:12
Rood laserlicht 3
-
17:30
Herleiden afmetingen vanaf een foto 21
-
16:34
[wiskunde] Prijs Product per KG; Alternatief Inzicht 3
-
13:57
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 9
-
13:16
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 17
-
13:12
[natuurkunde] kroon van koning op Syracuse 10
-
25 apr
2013 – Augustus Vraag 3 3
-
24 apr
Vraag 2009 Juli Vraag 5 5
-
24 apr
positie 2
-
24 apr
Schroefdraad berekening 8
-
24 apr
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
-
23 apr
Weerfrustratie 9
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
pieken bij sequencing PCR
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 167
pieken bij sequencing PCR
“Twenty years from now you will be more disappointed by the things that you didn't do than by the ones you did do. So throw off the bowlines. Sail away from the safe harbor. Catch the trade winds in your sails. Explore. Dream. Discover.”
-
- Berichten: 2.399
Re: pieken bij sequencing PCR
Ken je detectie methode niet, maar nogmaal gesproken is oppervlakte onder de piek linear gecorreleerd aan concentratie/massa
-
- Berichten: 167
Re: pieken bij sequencing PCR
Is is via capillaire gelelektroforese en op het einde worden de fragmenten dan door een detector gestuurd. Wanneer excitatie van een welbepaald fluorchroom gebeurd krijg je een piek van een welbepaald nucleotide.
Het toestel is van applied bioscience
Het toestel is van applied bioscience
“Twenty years from now you will be more disappointed by the things that you didn't do than by the ones you did do. So throw off the bowlines. Sail away from the safe harbor. Catch the trade winds in your sails. Explore. Dream. Discover.”
-
- Berichten: 516
Re: pieken bij sequencing PCR
Een toestel voor capillaire gelektroforese voor sequencing geeft meestal geen eenduidige relatie tussen het aantal fragmenten en de piekgrootte. Op zo'n chromatogram zitten meestal een het begin heel kleine piekjes, in het midden, duidelijke pieken en op het einde weer kleinere. Dit is veelal gewoon een interferentiefout van de detector.
Trouwens, wat heb je er aan om via deze methode ook het aantal fragmenten te weten te komen? Ik denk dat je dat op een veel beter en kwalitatievere manier kan doen door een eenvoudige gelelektroforese met een gekende ladder.
Trouwens, wat heb je er aan om via deze methode ook het aantal fragmenten te weten te komen? Ik denk dat je dat op een veel beter en kwalitatievere manier kan doen door een eenvoudige gelelektroforese met een gekende ladder.
-
- Berichten: 167
Re: pieken bij sequencing PCR
ik wil de het aantal fragmenten niet weten hoor. Ik vroeg me gewoon af of er een verband bestaat tussen de grootte van die pieken en het hoeveelheid materiaal. Dus dit is niet het geval dan?
“Twenty years from now you will be more disappointed by the things that you didn't do than by the ones you did do. So throw off the bowlines. Sail away from the safe harbor. Catch the trade winds in your sails. Explore. Dream. Discover.”
-
- Berichten: 740
Re: pieken bij sequencing PCR
Er is wel een verband met de piekhoogte en de hoeveelheid fragmenten. Hoe hoger de piek, hoe meer signaal, hoe meer fragmenten.
Dye blobs, die eruit zie als grote en brede pieken hebben vaak veel signaal en die zie je ook terug in je chromatogram.
Dye blobs, die eruit zie als grote en brede pieken hebben vaak veel signaal en die zie je ook terug in je chromatogram.
-
- Berichten: 516
Re: pieken bij sequencing PCR
Mja, oké er is een verband. Dat verband is er altijd. Maar dan nog. Het is niet de bedoeling om die informatie uit een sequencing machine te halen. Daar wil je enkel een sequentieanalyse uit puren.
Mijns inziens is zo'n detector niet nauwkeurig genoeg.
Daarenboven moet je dan ook een gekende concentratie toevoegen om te zien welke piek je daaruit krijgt, om zo de relatie tussen piekoppervlak en concentratie te weten te komen...
Mijns inziens is zo'n detector niet nauwkeurig genoeg.
Daarenboven moet je dan ook een gekende concentratie toevoegen om te zien welke piek je daaruit krijgt, om zo de relatie tussen piekoppervlak en concentratie te weten te komen...
