Springen naar inhoud

Posttranslationele modificatie


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 10 oktober 2012 - 11:35

Oefenvraag:

Fosforylering is een vorm van posttranslationele modificatie. In figuur 3 (zie hieronder) zijn een viertal aminozuren weergegeven. Welk van de gegeven aminozuren in een interne peptide sequentie is een mogelijk substraat voor fosforylering?

A. Alanine
B. Phenylalanine
C. Serine
D. Leucine

2012-10-10 12.25.01.jpg

Ik weet dat een posttranslationele modificatie een eiwitverandering is, na de synthese (tijdens de translatie). Er kunnen dan allerlei groepen aan het eiwit zijn gebonden, zoals fosfaatgroepen, suikergroepen etc.

Maar ik weet niet hoe ik verder moet redeneren om tot het juiste antwoord te komen...

Zo weet ik niet wat ze precies bedoelen met een interne peptide, hoe ik dat aan de molecuulformule kan zien en op welke manier ik dat kan reflecteren aan de vraag en antwoordopties.
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 10 oktober 2012 - 14:07

Zo weet ik niet wat ze precies bedoelen met een interne peptide

Je beschouwt eigenlijk een polypeptide met daarin (intern) een alanine, fenylalanine, serine of leucine residu. Op die manier verdwijnen er heel wat reactieve groepen. Zie je wat er overblijft? Of m.a.w. waar fosforylatie mogelijk is?
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill

#3

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 10 oktober 2012 - 14:15

Op die manier verdwijnen er heel wat reactieve groepen.


Hmm, dat heb ik nog niet helemaal door. Hoe verdwijnen er groepen als alanine, fenylalanine, serine of leucine in een peptide zitten... 8-[

Ik weet wel dat voor fosforylering OH-groepen nodig zijn, waardoor optie D (Leucine) al afvalt.
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

#4

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 10 oktober 2012 - 17:09

Hmm, dat heb ik nog niet helemaal door. Hoe verdwijnen er groepen als alanine, fenylalanine, serine of leucine in een peptide zitten... 8-[

Een aminofunctie en een carboxylfunctie zijn reactief. Teken eens een tripeptide van bijv. Gly-Ala-Ser en kijk eens naar alanine, valt je iets op?
Verborgen inhoud
Tekenen of neerschrijven met symbolen is ook goed hoor, iets als H3N+-CH(H)-.... is eigenlijk al voldoende.



Ik weet wel dat voor fosforylering OH-groepen nodig zijn, waardoor optie D (Leucine) al afvalt.

Dat is sowieso al goed ;).
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill

#5

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 11 oktober 2012 - 15:56

Teken eens een tripeptide van bijv. Gly-Ala-Ser en kijk eens naar alanine, valt je iets op?


Ehm, dan zou ik op het volgende uitkomen (de golftekentjes even niet meegetekend):

2012-10-11 16.56.46.jpg

Ik zie niets bijzonders, behalve dat uiteraard alle drie de aminozuren een wat andere structuurformule krijgen door de samenvoeging en er daarbij 2H2O ontstaat.

Alanine los is: C3O2NH7
Bij reactie: C3ONH5

Ofwel: er is een H2O verdwenen...zoals al in m'n tekening zichtbaar was.
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

#6

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 11 oktober 2012 - 19:09

Je hebt wat aparte aminozuren, je mist een koolstofatoom met zijketen bij glycine en ook bij serine...

Gly-Ala-Ser.png


De bedoeling van die tekening was om te kijken naar het middelste aminozuur (hier alanine) en dit te vergelijken met de losse toestand. Zoals je in de figuur ziet wordt er een peptidebinding (het zwarte lijntje) gevormd tussen Gly-Ala en Ala-Ser. Daarbij komt, zoals je al aanhaalde, steeds een watermolecule vrij.

Verder zie je dat de aminogroep van alanine vast zit in die peptidebinding, hetzelfde geldt voor de carboxylgroep achteraan.

Dit wetende, denk je dan dat aminogroep en/of de carboxylgroep gebruikt kan worden voor posttranslationele modificatie? Wat zou er dan wel gebruikt kunnen worden?
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill

#7

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 13 oktober 2012 - 12:28

Je hebt wat aparte aminozuren, je mist een koolstofatoom met zijketen bij glycine en ook bij serine...


Oeps... :oops:

Dit wetende, denk je dan dat aminogroep en/of de carboxylgroep gebruikt kan worden voor posttranslationele modificatie? Wat zou er dan wel gebruikt kunnen worden?


De OH-groep van serine...?
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

#8

Typhoner

    Typhoner


  • >1k berichten
  • 2446 berichten
  • VIP

Geplaatst op 13 oktober 2012 - 16:49

De OH-groep van serine...?


jep.

In essentie bevat elk aminozuur een OH-groep (in het carbonzuurstuk), maar die verdwijnen bij het vormen van de peptidebinding. Serine heeft er dan nog eentje over (kort door de bocht natuurlijk, gezien een OH van COOH wel verschilt van een OH die apart staat).

Veranderd door Typhoner, 13 oktober 2012 - 16:50

This is weird as hell. I approve.

#9

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 13 oktober 2012 - 16:59

Ok, ik heb het weer op een rijtje! :)

Bedankt beide!
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

#10

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 14 oktober 2012 - 10:34

Om diezelfde reden (een vrije OH-groep op de zijketen) zijn threonine en tyrosine ook twee typische substraten voor fosforylatie.
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures