Springen naar inhoud

Sanger sequention


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 20 oktober 2012 - 11:53

Schermafdruk-35.jpg

Ik begrijp nog niet helemaal waarom het kleinste stukje het diepst (meest naar beneden) in de gel beland, aangezien ik juist zou verwachten dat de strand met de meeste nucleotiden dit zal doen vanwege een groter gewicht. Hoe zit dit?
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Typhoner

    Typhoner


  • >1k berichten
  • 2446 berichten
  • VIP

Geplaatst op 20 oktober 2012 - 12:27

Het heeft iig niets met zwaartekracht te maken, het maakt niet zo uit of het ding horizontaal ligt of niet.

De scheiding gebeurt met gelelektroforese: lichte stukjes zijn mobieler dan zware en gaan dus sneller bewegen.
This is weird as hell. I approve.

#3

Cura

    Cura


  • >1k berichten
  • 2956 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 20 oktober 2012 - 12:31

De scheiding gebeurt met gelelektroforese: lichte stukjes zijn mobieler dan zware en gaan dus sneller bewegen.


Ik weet wat gelelektroforese inhoudt, maar vind het principe wat vaag van de deeltjes. Mag ik het dan een beetje vergelijken met massaspectrometrie, in de zin dat de zwaarste deeltjes het eerste tegen die plaat aankomen en de lichtere deeltjes nog even door schieten vooraleer tegen de plaat te botsen?
Small opportunities are often the beginning of great enterprises. (Demosthenes, 384 BC - 322 BC)

#4

Typhoner

    Typhoner


  • >1k berichten
  • 2446 berichten
  • VIP

Geplaatst op 20 oktober 2012 - 14:57

Het is meer een zeef-effect: de gel is poreus en kan dus worden gezien als bestaande uit kanaaltjes van verschillende grootte. Kleine fragmenten passen door de meeste poriën en gaan dus min of meer rechtdoor, terwijl de grote fragmenten alleen door grote poriën kunnen en vaker "omwegen" moeten maken "op zoek" naar poriën die groot genoeg zijn.

Veranderd door Typhoner, 20 oktober 2012 - 14:57

This is weird as hell. I approve.

#5

Sjitty

    Sjitty


  • >250 berichten
  • 320 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 28 oktober 2012 - 00:07

Het is meer een zeef-effect: de gel is poreus en kan dus worden gezien als bestaande uit kanaaltjes van verschillende grootte. Kleine fragmenten passen door de meeste poriën en gaan dus min of meer rechtdoor, terwijl de grote fragmenten alleen door grote poriën kunnen en vaker "omwegen" moeten maken "op zoek" naar poriën die groot genoeg zijn.


Dit is toch een gevaarlijke vergelijking gezien scheiding aan de hand van gelfiltratie (een andere techniek) net door het feit dat grotere moleculen de kleine kanaaltje omzeilen sneller tot beneden geraken terwiil de kleine moleculen een ommeweg moetn maken doorheen de kleinere poriën. Bij gelelektroferese is er een algemene poriengrootte (afhankelijk van je percentage gel maar overal ongeveer gelijk (dus geen grote en kleine poriën) en grotere moleculen ondervinden gewoon meer weerstand.

#6

Sjitty

    Sjitty


  • >250 berichten
  • 320 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 28 oktober 2012 - 00:26

hier is het goed uitgelegd (vooral ook waarom de lading, die nochtans groter is bij grotere moleculen (althans bij een standaard SDS-PAGE), geen snellere migratie verzoorzaakt, en enkel de grootte van he eiwit het meest bepalend is voor de migratiesnelheid door een hogere weerstand doorheen de gel)

http://bitesizebio.c...sds-page-works/

Ik weet wat gelelektroforese inhoudt, maar vind het principe wat vaag van de deeltjes. Mag ik het dan een beetje vergelijken met massaspectrometrie, in de zin dat de zwaarste deeltjes het eerste tegen die plaat aankomen en de lichtere deeltjes nog even door schieten vooraleer tegen de plaat te botsen?


Het is zo goed als niet vergelijkbaar met massaspectrometrie (waar net WEL ook gebruik gemaakt wordt van ladingsverschillen en massaverschillen (LET OP massa <> grootte) terwijl GE gebruik maakt van grootte verschillen). In massaspectrometriee bereiken de lichtste deeltjes (correcter is ionen met de laagste m/z waarde) trouwens als eerste de detector (indien ze een gelijke lading dragen als de zwaardere) omdat ze meer versneld worden in het heersend elektrisch veld. Zie link voor de goede uitleg van GE ;)

Veranderd door Sjitty, 28 oktober 2012 - 00:33






0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures