Hallo,
Wanneer je een plasmide DNA op een agarose gel zet krijg je 3 banden: een lineaire band, een band van supercoiled plasmide die sneller loopt en een band met nicked DNA die juist meer vertraagd wordt.
Mijn vraag gaat over het loopgedrag van nicked lineair DNA met een lengte van 1 kb.. Hoe loopt dat op een 0,8% agarose gel t.o.v. het intacte lineaire DNA? Heeft iemand daar ervaring mee?
Alvast bedankt,
Theo
Laatste berichten
-
20:14
Aardlek-schakelaar 2
-
19:55
wig 9
-
15:56
Programmeren met vectoren 6
-
14:53
Straatklok loopt 5 minuten voor 12
-
23:12
speciale rel. theorie 10
-
22:36
Gravity and gravitation 4
-
22:24
[scheikunde] vraag Chemie - wat is de oplossing? 10
-
25 apr
Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 10
-
25 apr
Vogels in de stad zijn goede klussers 2
-
25 apr
Rood laserlicht 3
-
25 apr
Herleiden afmetingen vanaf een foto 21
-
25 apr
[wiskunde] Prijs Product per KG; Alternatief Inzicht 3
-
25 apr
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 9
-
25 apr
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 17
-
25 apr
[natuurkunde] kroon van koning op Syracuse 10
-
25 apr
2013 – Augustus Vraag 3 3
-
24 apr
Vraag 2009 Juli Vraag 5 5
-
24 apr
positie 2
-
24 apr
Schroefdraad berekening 8
-
24 apr
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
nicked lineair DNA
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 8.557
Re: nicked lineair DNA
een plasmide bestaat niet in nicked lineaire vorm. De nicked open-circulaire vorm bestaat wel.
Kijk voor meer info eens hier:
http://en.wikipedia.org/wiki/Plasmid#Conformations
Kijk voor meer info eens hier:
http://en.wikipedia.org/wiki/Plasmid#Conformations
"Meep meep meep." Beaker
-
- Berichten: 74
Re: nicked lineair DNA
Hallo Wouter,
Dank je wel voor je reactie. Ik denk dat je mijn vraag niet goed gelezen. Mijn vraag gaat namelijk niet over een plasmide in nicked lineaire vorm. Mijn vraag gaat over nicked lineair DNA van 1kb. Het betreft een PCR product waar ik de nicks zelf in aangebracht heb. Om precies te zijn 5 stuks binnen een lengte van 60 bp.
Ik hoop dat je ook een antwoord op mijn vraag hebt.
groetjes,
Theo
Dank je wel voor je reactie. Ik denk dat je mijn vraag niet goed gelezen. Mijn vraag gaat namelijk niet over een plasmide in nicked lineaire vorm. Mijn vraag gaat over nicked lineair DNA van 1kb. Het betreft een PCR product waar ik de nicks zelf in aangebracht heb. Om precies te zijn 5 stuks binnen een lengte van 60 bp.
Ik hoop dat je ook een antwoord op mijn vraag hebt.
groetjes,
Theo
-
- Berichten: 74
Re: nicked lineair DNA
Om m'n eigen vraag dan maar te beantwoorden: wanneer ik m'n PCR fragment op een 6% polyacrylamide/TBE gel run, veroorzaken de 5 nicks een enorm verschil in loopsnelheid. En nog verbazingwekkender: het verschil is ook goed te zien wanneer de nicks in een 6 kb PCR fragment aangebracht worden. Op een agarose gel zijn deze verschillen in loopgedrag niet waarneembaar.
-
- Berichten: 3.963
Re: nicked lineair DNA
Uit interesse Theo, lopen ze sneller?
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill
-
- Berichten: 74
