Springen naar inhoud

eiwit stollingsfactor VIII


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Stefke1000

    Stefke1000


  • >25 berichten
  • 59 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 14 november 2013 - 19:41

Het eiwit draagt bij bij de coagulatie van bloed. Factor VIII is ook mede een eiwit die (deels) ontbreekt bij mensen met Hemofilie A.
http://www.ebi.ac.uk...2q/primary.html
Op bovenstaande site heb ik dit model gevonden van het eiwit. Onderstaande afbeelding komt van de Engelstalige wikipedia over Factor VIII.
Enkele vraagjes:
- naar mijn weten bestaat een eiwit uit een keten van meerdere aminozuren. Bij de primaire structuur op bovenstaande site staat hiervan dit:

A T R R Y Y L G A V E L S W D Y M Q S D L G E L P V D A R F P P R V P K S F P F N T S V V Y K K T L F V E F T D H L F N
Waar staan de bovenstaande letters voor? voor een aminozuur?

- Wat valt er bij dit eiwit te zeggen over de quaternaire structuur? Bestaat dit eiwit eigenlijk uit twee aaneengeschakelde eiwitten (A en C)?


Geplaatste afbeelding



- Het gen bij patiënten met hemofilie A is gemuteerd. Bij deze patiënten vind in veel gevallen wel een productie plaats van het eiwit factor VIII. Hoe kan het dat een gemuteerd gen toch de mogelijkheid heeft om een eiwit te maken?

Veranderd door Stefke1000, 14 november 2013 - 19:42


Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 15 november 2013 - 00:30

- naar mijn weten bestaat een eiwit uit een keten van meerdere aminozuren. Bij de primaire structuur op bovenstaande site staat hiervan dit:

A T R R Y Y L G A V E L S W D Y M Q S D L G E L P V D A R F P P R V P K S F P F N T S V V Y K K T L F V E F T D H L F N
Waar staan de bovenstaande letters voor? voor een aminozuur?

Dat klopt, een eiwit bestaat inderdaad uit een lange aaneenschakeling van verschillende aminozuren. Aminozuren kan je voluit schrijven, maar ieder aminozuur heeft ook een officiële 3-letter en 1-lettercode. Op die manier staat bijv. A voor Alanine (Ala), T voor Threonine (Thr) en R voor Arginine (Arg). Uit die aminozuursequentie die daar staat kan je dus al eenvoudig de eerste aminozuren aflezen en zien welke daarop volgen.

Ter info: de volledige lijst met 1- en 3-lettercodes kan je hier lezen.

- Wat valt er bij dit eiwit te zeggen over de quaternaire structuur? Bestaat dit eiwit eigenlijk uit twee aaneengeschakelde eiwitten (A en C)?

Dat klopt ook. Qua eiwitstructuur spreekt men over vier stadia
  • De primaire structuur van een eiwit is gewoon de lineaire sequentie van aminozuren. Ieder aminozuur is covalent gebonden aan het volgende en alles vormt een soort van lange draad.
  • In de secundaire structuur gebeuren lokale opvouwingen en ontstaan 3 dimensionale structuren zoals alfa-helices en beta-sheets (de pijlen op de figuur).
  • De tertiaire structuur is vervolgens de volledige opvouwing van één eiwitketen.
  • En bij de quaternaire structuur gaan meerdere opgevouwen eiwitketens met elkaar interageren waarbij ze een functioneel complex vormen.
Dat laatste is in jouw voorbeeld ook het geval. Je hebt de groene eiwitketen (de heavy chain) die interageert met de blauwe eiwitketen (light chain) en die samen één functioneel eiwit(complex) vormen, namelijk stollingsfactor VIII. Dergelijke eiwitten worden ook wel heterodimeren genoemd, ze bestaan uit twee (di) verschillende (hetero) eenheden.

- Het gen bij patiënten met hemofilie A is gemuteerd. Bij deze patiënten vind in veel gevallen wel een productie plaats van het eiwit factor VIII. Hoe kan het dat een gemuteerd gen toch de mogelijkheid heeft om een eiwit te maken?

Ik weet niet precies op welke mutatie het gaat, maar wat perfect mogelijk zou kunnen zijn is dat het gaat om een missense mutatie. Dit is een mutatie waardoor één aminozuur in de eiwitsequentie gewijzigd wordt door een ander. Zoiets kan onschuldig zijn, maar het kan ook de volledige opvouwing van het eiwit in de war sturen en op die manier de functionele activiteit blokkeren.
Een dergelijke mutatie zal dus niet direct de eiwitproductie beïnvloeden, maar de functie kan echter wel volledig verloren gaan.

Merk op: ik speculeer hier over het effect van een mogelijke mutatie, het is niet gezegd dat deze theorie correct is. Ik zou eerst eens moeten opzoeken welke mutaties gekend zijn bij patiënten met hemofilie A om een meer concretere onderbouwing te geven. Wat ik schreef is louter een suggestie van een mogelijke oorzaak met als doel het principe te schetsen.
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill

#3

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 17 november 2013 - 11:12

Ter info:

The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. Of particular interest for the understanding of the function of F8 is the category of CRM (cross-reacting material) positive patients (approximately 5%) that have considerable amount of F8 in their plasma (at least 30% of normal), but the protein is non-functional; i.e. the F8 activity is much less than the plasma protein level. CRM-reduced is another category of patients in which the F8C antigen and activity are reduced to approximately the same level. Most mutations are CRM negative, and probably affect the folding and stability of the protein.

Bron: Swiss-Prot (http://www.uniprot.o...ection_comments) en bijhorende referenties.
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill

#4

Stefke1000

    Stefke1000


  • >25 berichten
  • 59 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 19 november 2013 - 19:31

dankjewel! Het is allemaal helemaal duidelijk, alleen het laatste puntje nog niet...

Most mutations are CRM negative, and probably affect the folding and stability of the protein.

In de meeste gevallen zijn de mutaties in het gen voor Hemofilie A dus CRM-negatief. Hierdoor zou het kunnen dat deze mutatie dan het vouwen en de werking van het eiwit beïnvloed.
*Ik heb op internet niet duidelijk kunnen vinden wat een CRM-mutatie is? (Cross-reacting material mutatie)
Kan iemand dat in het kort uitleggen?

''Er zijn 5 typen mutaties gevonden in dit onderzoek, namelijk deleties (9), inserties
(3), missense muaties (18), nonsense mutaties (4) en splice-site mutaties (4).''
bron: http://hbo-kennisban...ow.cgi?fid=3483

*Er vind één van bovenstaande mutaties plaats in het x-chromosoom. Vervolgens krijgen alle x-chromosomen deze afwijking mee. Ik begrijp nog steeds niet hoe het dan mogelijk is dat er 'werkende FVIII eiwitten' ontstaan, en 'niet-werkende FVIII eiwitten ontstaan'. Door hetzelfde DNA zullen ze toch allemaal hetzelfde worden gevouwen, en zullen ze toch allemaal dezelfde aminozuur-volgorde meekrijgen?

Veranderd door Stefke1000, 19 november 2013 - 19:32


#5

Kravitz

    Kravitz


  • >1k berichten
  • 4042 berichten
  • Moderator

Geplaatst op 22 november 2013 - 21:15

In de meeste gevallen zijn de mutaties in het gen voor Hemofilie A dus CRM-negatief. Hierdoor zou het kunnen dat deze mutatie dan het vouwen en de werking van het eiwit beïnvloed.

Dat klopt, wanneer een eiwit foutief opvouwt gaat de biologische functie ervan verloren.

*Ik heb op internet niet duidelijk kunnen vinden wat een CRM-mutatie is? (Cross-reacting material mutatie)
Kan iemand dat in het kort uitleggen?

Dat is een mutatie die ervoor zorgt dat er een inactief eiwit ontstaat dat echter nog gelijkaardige eigenschappen bezit als het wild-type eiwit. Met andere woorden kan het mutante eiwit bijv. nog herkend worden door andere enzymen en net zoals het wild-type eiwit gemodificeerd worden (bijv. gefosforyleerd). Niet tegenstaande deze eigenschap zal het mutante eiwit niet of verminderd actief zijn.


*Er vind één van bovenstaande mutaties plaats in het x-chromosoom. Vervolgens krijgen alle x-chromosomen deze afwijking mee. Ik begrijp nog steeds niet hoe het dan mogelijk is dat er 'werkende FVIII eiwitten' ontstaan, en 'niet-werkende FVIII eiwitten ontstaan'. Door hetzelfde DNA zullen ze toch allemaal hetzelfde worden gevouwen, en zullen ze toch allemaal dezelfde aminozuur-volgorde meekrijgen?

In je quote spreken ze over splice-site mutaties. Deze mutates kunnen zeker aan de oorzaak liggen van verschillende isotypes FVIII eiwit die ontstaan. Door zo'n mutatie wordt bijv. een extra splice site ingevoegd of wordt er een verwijderd. Als gevolg hiervan kan de splicing machinerie eigenlijk kiezen welke sites het gebruikt. In sommige gevallen zal die machinerie gebruik maken van de correct sites en zal een natuurlijk eiwit gevormd worden. In andere gevallen maakt het gebruik van de extra splice site waardoor een stuk van een intron behouden blijft of een stuk exon verdwijnt. Bijgevolg resulteert dit in defectief FVIII. Op die manier verkrijg je zowel defectief als intact eiwit uit één mRNA dat een extra splice site bevat.
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures