Vmax en Km berekenen met Michaelis-Menten
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 2
Vmax en Km berekenen met Michaelis-Menten
Hallo allemaal,
Ik heb even een vraagje over het berekenen van Vmax en Km met behulp van een Michaelis-Menten vergelijking.
Ik heb data van de activiteit van een enzym met excel in een tabel en grafiek gezet en daarmee de trendlijn gemaakt. De formule van de trendlijn is y = 0,0003ln(x) + 0,0008. Hieruit kan ik geen Vmax halen omdat deze formulie geen horizontale asymptoot heeft.
Dus mijn vraag is, hoe kan ik dit omrekenen naar een formule die wel een asymptoot heeft of is er een andere manier om de juiste formule te krijgen?
Met een lineweaver-Burkplot en Eadie-Hofsteeplot heb ik de Vmax en Km al berekend, maar omdat daar erg verschillende antwoorden uit komen wil ik het ook met de Michaelis-Menten proberen.
Alvast bedankt,
Sjoerd Jan
Ik heb even een vraagje over het berekenen van Vmax en Km met behulp van een Michaelis-Menten vergelijking.
Ik heb data van de activiteit van een enzym met excel in een tabel en grafiek gezet en daarmee de trendlijn gemaakt. De formule van de trendlijn is y = 0,0003ln(x) + 0,0008. Hieruit kan ik geen Vmax halen omdat deze formulie geen horizontale asymptoot heeft.
Dus mijn vraag is, hoe kan ik dit omrekenen naar een formule die wel een asymptoot heeft of is er een andere manier om de juiste formule te krijgen?
Met een lineweaver-Burkplot en Eadie-Hofsteeplot heb ik de Vmax en Km al berekend, maar omdat daar erg verschillende antwoorden uit komen wil ik het ook met de Michaelis-Menten proberen.
Alvast bedankt,
Sjoerd Jan
- Berichten: 8.557
Re: Vmax en Km berekenen met Michaelis-Menten
Kan je de enzym activiteit data toevallig delen?
Als ik die formule in een grafiek zet zie ik namelijk wel een horizontale asymptoot
Als ik die formule in een grafiek zet zie ik namelijk wel een horizontale asymptoot
- Bijlagen
-
- graph_20160627_013133.png (12.27 KiB) 2230 keer bekeken
"Meep meep meep." Beaker
-
- Berichten: 2
Re: Vmax en Km berekenen met Michaelis-Menten
Hoi Wouter, ik stuur het je even in een privébericht i.v.m. plagiaatcontrole (ik moet dit nog inleveren).
Dat lijkt inderdaad zo, maar bij mijn weten heeft een ln-functie heeft geen horizontale asymptoot.
Dat lijkt inderdaad zo, maar bij mijn weten heeft een ln-functie heeft geen horizontale asymptoot.
- Berichten: 8.557
Re: Vmax en Km berekenen met Michaelis-Menten
De data die je me toestuurde laat zich plotten in een Michaelis-Menten plot
met een Vmax van 0.001970 stdError 0.0001267 en Km van 2.068 met een Std. Error van 0.6163
Het probleem zit 'm waarschijnlijk hoe je een trendlijn fit. Ik heb hier een non-linear fit gekozen en dan werkt het prima.
Alle analyse is trouwens gedaan in Prism.
met een Vmax van 0.001970 stdError 0.0001267 en Km van 2.068 met een Std. Error van 0.6163
Het probleem zit 'm waarschijnlijk hoe je een trendlijn fit. Ik heb hier een non-linear fit gekozen en dan werkt het prima.
Alle analyse is trouwens gedaan in Prism.
- Bijlagen
-
- sjoerdjan.png (51.23 KiB) 2230 keer bekeken
"Meep meep meep." Beaker