Laatste berichten
-
23:12
speciale rel. theorie 10
-
22:57
Straatklok loopt 5 minuten voor 11
-
22:57
wig 6
-
22:36
Gravity and gravitation 4
-
22:24
[scheikunde] vraag Chemie - wat is de oplossing? 10
-
19:47
Bruine vlekken op treinaanwijzerbord 10
-
19:44
Vogels in de stad zijn goede klussers 2
-
19:12
Rood laserlicht 3
-
17:30
Herleiden afmetingen vanaf een foto 21
-
16:34
[wiskunde] Prijs Product per KG; Alternatief Inzicht 3
-
13:57
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 9
-
13:16
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 17
-
13:12
[natuurkunde] kroon van koning op Syracuse 10
-
10:15
2013 – Augustus Vraag 3 3
-
24 apr
Vraag 2009 Juli Vraag 5 5
-
24 apr
positie 2
-
24 apr
Schroefdraad berekening 8
-
24 apr
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
-
23 apr
Weerfrustratie 9
-
23 apr
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 3
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
Ligase
Moderator: ArcherBarry
Forumregels
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
-
- Berichten: 824
Re: Ligase
Ik heb helaas geen echt duidelijk plaatje kunnen vinden, maar kijk bijvoorbeeld eens hiernaar: http://opbs.okstate.edu/~petracek/Chapter%...Fig%2025-16.JPG
In woorden is dit als volgt:
1. Het DNA-ligase reageert met een molecuul ATP tot Enzym-AMP + PPi
2. Het enzym-AMP-complex draagt de geactiveerde AMP-eenheid over aan de 5' fosfaatgroep van een te ligeren DNA-fragment
3. De 3' OH-groep van het andere DNA-fragment valt aan op de geactiveerde 5' fosfaatgroep, waarbij het AMP weer vrijkomt en het gat is gedicht
Deze energetisch ongunstige reactie wordt dus gedreven door de energetisch gunstige hydrolyse van een molecuul ATP
In woorden is dit als volgt:
1. Het DNA-ligase reageert met een molecuul ATP tot Enzym-AMP + PPi
2. Het enzym-AMP-complex draagt de geactiveerde AMP-eenheid over aan de 5' fosfaatgroep van een te ligeren DNA-fragment
3. De 3' OH-groep van het andere DNA-fragment valt aan op de geactiveerde 5' fosfaatgroep, waarbij het AMP weer vrijkomt en het gat is gedicht
Deze energetisch ongunstige reactie wordt dus gedreven door de energetisch gunstige hydrolyse van een molecuul ATP
Ik wou dat ik een elektron was, dan kon ik altijd paren
-
- Berichten: 8.557
Re: Ligase
veel dank, maar ik ben bang dat ik hier niet veel aan heb. Ik moet dit namelijk in een presentatie gebruiken zonder al te moeilijk te gaan liggen doen. dit alleen al uitleggen duurt 5 minuten. de hele presentatie zelf mag maar 5 minuten duren met 5 minuten uitloop
"Meep meep meep." Beaker
-
- Berichten: 311
Re: Ligase
Moet je niet veel aan uitleggen.
Dit reageert met dat, en dit met dat...vereenvoudigde figuurtjes uitprinten en voilà!
groetkes
Dit reageert met dat, en dit met dat...vereenvoudigde figuurtjes uitprinten en voilà!
groetkes
Only an optimist can see the nature of suffering
-
- Berichten: 8.557
Re: Ligase
dus als ik het goed begrijp (kort door de bocht genomen) dan neemt het ATP molecuul een electron op van de fosfaatgroep van de 5' en kan zo de breuk worden gesloten
ps. gebeurt er eigenlijk nog iets met de -OH aan de 3'
ps. gebeurt er eigenlijk nog iets met de -OH aan de 3'
"Meep meep meep." Beaker
-
- Berichten: 824
Re: Ligase
Niet ATP maar AMP. En dit molecuul neemt een electron plus een zuurstofatoom over van de 5' fosfaatgroep. De 3' OH doneert bij de aanval vervolgens weer een electron en een zuurstofatoom aan de 5'-groep, waarbij de H als H+ vrijkomt. De reacties met water worden in deze gevallen niet vermeld, omdat een biologisch milieu in principe een waterig milieu is. Water (en daarom ook H+ en OH-) mogen dus gewoon onvermeld meedoen in de reacties.
Ik wou dat ik een elektron was, dan kon ik altijd paren
-
- Berichten: 8.557
Re: Ligase
de okazaki fragmenten zijn de delen van het DNA die worden gevormd aan de lagging strand. Allemaal kleine delen DNA.
"Meep meep meep." Beaker
-
- Berichten: 704
Re: Ligase
DNA polymerase kan alleen van 5' naar 3' synthetiseren en de lagging strand gaat van 3' naar 5'. Er ontstaat een loop in het DNA, waardoor DNA-polymerase III holoenzym na ongeveer 1000 nucleotiden losraakt van de lagging strand.
gevolg is dat er fragmetnjes DNA ontstaan en die worden door polymeease I afgemaakt.
De RNA-primer is nodig om polymerase III te kunnen laten synthetiseren (DNA polymerase heeft namelijk een primer nodig)
de stukjes DNA die door het holoenzym worden geproduceerd worden Okazaki-fragmenten genoemd. Deze worden aan elkaar gezet met behulp van DNA ligase.
gevolg is dat er fragmetnjes DNA ontstaan en die worden door polymeease I afgemaakt.
De RNA-primer is nodig om polymerase III te kunnen laten synthetiseren (DNA polymerase heeft namelijk een primer nodig)
de stukjes DNA die door het holoenzym worden geproduceerd worden Okazaki-fragmenten genoemd. Deze worden aan elkaar gezet met behulp van DNA ligase.
