De 79-jarige Nobelprijswinnaar James Watson, ontdekker van de DNA-structuur, was 31 mei de eerste die hét cadeau van de toekomst mocht ontvangen: zijn volledig in kaart gebrachte genoom, opgeslagen op twee dvds.
Lees meer... NRC
Laatste berichten
-
10:44
Schroefdraad berekening 8
-
00:15
[scheikunde] Kan chloorgas de geleiding van elektriciteit belemmeren? 9
-
22:27
positie 1
-
21:15
Weerfrustratie 9
-
18:08
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 15
-
14:16
do-re-mi-fa-so vliegtuigen 7
-
14:16
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 3
-
13:57
De Euro Nederlandse 100 qubit computer komt eraan
-
23 apr
projectiel 8
-
23 apr
Verschil tussen deze 2 vragen 5
-
23 apr
[scheikunde] berekeningen labo vitamine c bepaling 1
-
22 apr
[wiskunde] rode en witte ballen verdelen 8
-
22 apr
Rotatie van het heelal 41
-
22 apr
Muntje opgooien 14
-
21 apr
Reactiviteit silyl enol ethers 1
-
21 apr
Criterium voor vochtretentie
-
21 apr
speciale rel. theorie 5
-
21 apr
Vogels in de stad zijn goede klussers
-
21 apr
Ervaringen met "herontdekkingen" 15
-
20 apr
Herleiden afmetingen vanaf een foto 19
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
Revolutie in dna-sequencing brengt duizend-dollargenoom nabij
Moderator: Astro
-
- Berichten: 2.005
Revolutie in dna-sequencing brengt duizend-dollargenoom nabij
...verhit de dichloormono-oxide tot 277 graden Celcius en geniet van het effect...
-
- Berichten: 1.623
Re: Revolutie in dna-sequencing brengt duizend-dollargenoom nabij
Ik heb het artikel gelezen, maar sommige dingen snap ik nog niet helemaal (helemaal aan het eind van dat artikel, waar 5 stappen staan beschreven):
Aan elk geknipt DNA-strengetje wordt o.a. een klein stukje 'A' DNA geplakt, en een enzym gaat daardoor dat DNA-strengetje miljoenen malen kopieren. Waar is dat kopieren goed voor?
Verderop in het proces worden de DNA-strengetjes gecentrifugeerd, zodat na afloop op een kunststof kaartje in elk van de 1,6 miljoen gaatjes een DNA-strengetje zit. Maar hoe weet je na het sequencen van al die DNA-strengetjes in welke volgorde die DNA-strengetjes onderling geplaatst moeten worden? Dat centrifugeren van die DNA-strengetjes gaat immers volstrekt willekeurig?
Aan elk geknipt DNA-strengetje wordt o.a. een klein stukje 'A' DNA geplakt, en een enzym gaat daardoor dat DNA-strengetje miljoenen malen kopieren. Waar is dat kopieren goed voor?
Verderop in het proces worden de DNA-strengetjes gecentrifugeerd, zodat na afloop op een kunststof kaartje in elk van de 1,6 miljoen gaatjes een DNA-strengetje zit. Maar hoe weet je na het sequencen van al die DNA-strengetjes in welke volgorde die DNA-strengetjes onderling geplaatst moeten worden? Dat centrifugeren van die DNA-strengetjes gaat immers volstrekt willekeurig?
Beter kaal als geen haar want een kip snurkt
-
- Berichten: 12.262
Re: Revolutie in dna-sequencing brengt duizend-dollargenoom nabij
Het is niet zo heel duidelijk geformuleerd, maar ik denk dat ze met stap 2 PCR bedoelen, waarbij die 'extra stukjes' de primers zijn?
Het recombineren van de informatie op de losse stukjes tot 1 genoom is in de basis niet zo moeilijk. Je begint stap 1 niet met een enkele dna streng met het complete genoom, maar met meerdere. Het knippen van de stukjes is tamelijk willekeurig. Je krijgt dus verschillende stukjes, waarvan het einde van het ene overeenkomt met bijv het midden van het andere (afkomstig uit verschillende strengen van het oorspronkelijke DNA).
Vervolgens is het zaak om (middels computers) uit te vogelen hoe al die stukjes overlappen, en hoe dat in 1 genoom in elkaar zat. Zolang de stukjes ettelijke honderden bp groot zijn is dat best haalbaar, al kan het ook wel problemen geven als lange sequenties op meerdere plaatsen voorkomen.
Het recombineren van de informatie op de losse stukjes tot 1 genoom is in de basis niet zo moeilijk. Je begint stap 1 niet met een enkele dna streng met het complete genoom, maar met meerdere. Het knippen van de stukjes is tamelijk willekeurig. Je krijgt dus verschillende stukjes, waarvan het einde van het ene overeenkomt met bijv het midden van het andere (afkomstig uit verschillende strengen van het oorspronkelijke DNA).
Vervolgens is het zaak om (middels computers) uit te vogelen hoe al die stukjes overlappen, en hoe dat in 1 genoom in elkaar zat. Zolang de stukjes ettelijke honderden bp groot zijn is dat best haalbaar, al kan het ook wel problemen geven als lange sequenties op meerdere plaatsen voorkomen.
Victory through technology
-
- Berichten: 1.623
Re: Revolutie in dna-sequencing brengt duizend-dollargenoom nabij
Aha, dus dat kopieren is nodig om later makkelijker uit te vogelen hoe die losse DNA-strengen aan elkaar horen te zitten... Weer wat geleerd. 
Beter kaal als geen haar want een kip snurkt
-
- Berichten: 12.262
Re: Revolutie in dna-sequencing brengt duizend-dollargenoom nabij
Dat kopieren is ook wel nodig voor het bepalen van de basenvolgorde van de losse stukjes, al is dat afhankelijk van de preciese methode waarmee men dat doet. In het artikel lijken nieuwe technieken gebruiken te maken van een enkel molecuul, maar de gangbare zijn niet gevoelig genoeg om 1 los dna molecuul van bijv 100 bp te sequencen.
Het amplificeren van DNA voor dit soort werk is vrij elegant proces waarbij de hoeveelheid per PCR stap verdubbeld, dus de gevoeligheid an sich is zo'n ramp niet.
Het amplificeren van DNA voor dit soort werk is vrij elegant proces waarbij de hoeveelheid per PCR stap verdubbeld, dus de gevoeligheid an sich is zo'n ramp niet.
Victory through technology
