Microarray

Moderator: ArcherBarry

Forumregels
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
Reageer
Berichten: 167

Microarray

Dag iedereen,

Ik moet zelf een wetenschappelijk onderzoek op poten zetten. Welliswaar gewoon op papier.

In mijn 'uitgevonden' onderzoek zou ik een microarray analyse willen uitvoeren van de genen die tot expressie komen in de lever, meer bepaald te Huh7 cellijn. Daarna zou ik deze cellijn willen transfecteren met welbepaalde microRNA's. Vervolgens zou ik dan het effect willen zien van die microRNA's op de up of downregulatie van verschillende genen.

Nu vraag ik mij af, waar zou je zo een microarray van Huh7 cellen kunnen vinden? Zou je dat kunnen aankopen? Of kan je dit zelf maken?

bedankt
“Twenty years from now you will be more disappointed by the things that you didn't do than by the ones you did do. So throw off the bowlines. Sail away from the safe harbor. Catch the trade winds in your sails. Explore. Dream. Discover.”

Berichten: 163

Re: Microarray

Voor een standaard cellijn als Huh7, kun je o.a. terecht bij http://www.affymetrix.com/ .

Als ze commercieel verkrijgbaar zijn is dat vele malen goedkopere dan zelf (laten) maken.

Als je op zoek gaat, gebruik dat als zoekterm vaak "genechip" o.i.d.

Begrijp ik dat je al uit je onderzoeksopzet bent?

Berichten: 167

Re: Microarray

Drs.P schreef:Voor een standaard cellijn als Huh7, kun je o.a. terecht bij http://www.affymetrix.com/ .

Als ze commercieel verkrijgbaar zijn is dat vele malen goedkopere dan zelf (laten) maken.

Als je op zoek gaat, gebruik dat als zoekterm vaak "genechip" o.i.d.

Begrijp ik dat je al uit je onderzoeksopzet bent?
Ik heb even op die site gekeken, maar ik weet niet goed waar ik kan zien wat zij verkopen. ik denk niet dat zij een chip met het Huh7 genoom verkopen. Is er nog een andere mogelijkheid?
“Twenty years from now you will be more disappointed by the things that you didn't do than by the ones you did do. So throw off the bowlines. Sail away from the safe harbor. Catch the trade winds in your sails. Explore. Dream. Discover.”

Berichten: 163

Re: Microarray

Sorry dat ik op het moment even niet meer tijd heb, maar kijk eens in dit artikel:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14722306?dopt=Abstract

Zij gebruiken HG-U133A voor een vergelijkbaar onderzoek. (heb het niet uigebreid onderzocht)

Je wilt het celeigen miRNA inbrengen en vervolgens bekijken welk effect het op de genexpressie heeft? (ter vergelijking met het effect op Viraal RNA?)

Heb je nagedacht over vergelijking met een eventueel beschikbare primaire cellijn?

Berichten: 167

Re: Microarray

Ik heb je even een PM gestuurd met meer uitleg :D
“Twenty years from now you will be more disappointed by the things that you didn't do than by the ones you did do. So throw off the bowlines. Sail away from the safe harbor. Catch the trade winds in your sails. Explore. Dream. Discover.”

Reageer