[microcursus] wat is dna? (basis)

Jan van de Velde

Plaats in deze topic je vragen en opmerkingen over de [microcursus] Wat is DNA? (basis)

Er is ook een volledig overzicht van alle cursussen, FAQ's en handleidingen

-----------------------------------------------------------------------------------------

Hurm

Vanmiddag heb ik de uiterst leerzame DNA-cursus doorgespit. Er is me veel duidelijk geworden, maar er is een vraagje bij me blijven hangen:

Stel, we hebben een cel(kern) met daarin een stukje DNA, met de letters CGA (willekeurig gekozen).

Door transcriptie wordt er een mRNA-streng gevormd, met hier dus de letters GCU

Vervolgens komt hier een stukje tRNA aan te zitten: CGA

Korter: er wordt tRNA gevormd, dat gelijk is aan DNA (behalve dat bij tRNA de T is vervangen door een U).

Nu zijn er tabellen waarin je kunt lezen welk aminozuur er wordt gevormd per combinatie van drie letters. Maar mijn vraag is: welk aminozuur wordt er in de situatie hierboven gevormd, dus: naar welke combinatie van drie letters moeten we kijken?

Nu, in de tabellen komt een U voor, geen T, dus het DNA valt af. Dan blijven over het mRNA en het tRNA. Wordt er nou een aminozuur gevormd aan de hand van het mRNA, dus hier GCU (staat voor Ala),

of wordt het gevormd aan de hand van het tRNA, dus hier CGA (staat voor Arg)?

Jan van de Velde

Vanmiddag heb ik de uiterst leerzame DNA-cursus doorgespit. Er is me veel duidelijk geworden,

Namens de club bedankt voor het compliment

maar er is een vraagje bij me blijven hangen:

..//..

Als ik je vraag goed begrijp komt die er eigenlijk op neer hoe je zo'n codon-tabel zoals in die wiki-link

http://en.wikipedia.org/wiki/Codon

moet lezen.

Het komt er op neer dat de codes in die tabel gegeven zijn voor de basevolgorde op het mRNA.

Bijvoorbeeld, helemaal linksboven in die tabel staat UUU voor phenylalanine. Dat betekent dat er voor een stukje mRNA met codon UUU een phenylalanine gezocht wordt.

Ik kan me niet herinneren ooit tabellen met tRNA-codons gebruikt te hebben.

Maar een phenylalanine moet dan dus gekoppeld worden aan een tRNA met codon AAA.

En voordat dát weer verwarring schept: UUU is niet de enige mRNA code die voor phenylalanine codeert.

Nemen we mee om bij een toekomstige aanpassing even te verduidelijken.

Hurm

Jan van de Velde schreef:Als ik je vraag goed begrijp komt die er eigenlijk op neer hoe je zo'n codon-tabel zoals in die wiki-link

http://en.wikipedia.org/wiki/Codon

moet lezen.

Het komt er op neer dat de codes in die tabel gegeven zijn voor de basevolgorde op het mRNA.

Als examenklasser heb ik dit jaar al aardig wat met die tabellen geoefend. Dit levert geen problemen op, tenzij ik er teveel bij ga nadenken. Dan weet ik namelijk niet meer welke code ik moet opzoeken.. Maar het blauwe zinnetje (^) is de oplossing van mijn problemen. Thanks!

Drs.P

Om het verhaal nog maar eens compleet te maken:

Coding strand = mRNA

Aan de template strand wordt het RNA gesynthetiseerd, de template strand is dus de inverse van de coding strand.

Andere termen voor coding strand=sense strand=mRNA

Anti-sense=Non-sense=template strand

- en + strand heeft niets met de translatie te maken, dit is een orientatie van het chromosoom (afspraak per chromosoom)

Jan van de Velde

Drs.P schreef:Om het verhaal nog maar eens compleet te maken:

..//..

Klinkt alsof je er verstand van hebt (zonder enige spot bedoeld)

http://www.wetenschapsforum.nl/index.php?showtopic=84960

klik eens??

kasper90

Hurm schreef:Stel, we hebben een cel(kern) met daarin een stukje DNA, met de letters CGA (willekeurig gekozen).

Door transcriptie wordt er een mRNA-streng gevormd, met hier dus de letters GCU

Vervolgens komt hier een stukje tRNA aan te zitten: CGA

Korter: er wordt tRNA gevormd, dat gelijk is aan DNA (behalve dat bij tRNA de T is vervangen door een U).

Het zou dus zo moeten zijn:

Als we een stukje DNA van de codon-streng hebben met de letters CGA, dan heeft de template streng dus de letters GCT.

Door transcriptie wordt er een mRNA-streng gevormd, met hier dus de letters CGA.

Vervolgens komt hier een stukje tRNA aan te zitten: GCU

Korter: er wordt mRNA gevormd, dat gelijk is aan de codon streng van het DNA en tRNA dat gelijk is aan de template streng. (behalve dat de T is vervangen door een U)

Bij de tabellen met je kijken naar het mRNA (of naar de codon, en de T'tjes voor U'tjes vervangen).

Je moet hier dus kijken bij CGA (staat voor Arg).

Drs.P

Kasper90, je haalt codon en coderende streng door elkaar.

Een codon is een triplet (bestaat uit 3) van nucleïnezuren in een open reading frame. M.a.w. Het een stukje 3 lettercode wat vertaald wordt in een aminozuur.

De coderende streng is het stuk DNA wat gelijk is aan het mRNA.

Haal deze 2 niet door elkaar!

Jan van de Velde

kasper90 schreef:Het zou dus zo moeten zijn:

..//..

Drs.P schreef:..//..

Haal deze 2 niet door elkaar!

Een en ander lezende krijg ik de indruk dat er een ERNSTIGE fout in die cursus staat, en ik zie hem niet.

Even versimpeld:

mRNA is een (negatieve) kopie van DNA

tRNA moet dus dezelfde code hebben als het stukje DNA waarvan het MRNA gekopieerd werd, (dwz weer een negatief van het negatief, oftewel een positief) met dit verschil dat thymine is vervangen door uracil.

Net of ik in de voorgaande posts iets anders lees???

kasper90

Sorry voor mijn fout, ik haal wel vaker namer door elkaar, codon streng moet zijn coderende streng (ik weet alleen niet hoe ik mijn eigen bericht kan aanpassen :S )

@Jan van de Velde

volgens mij zeggen jij, ik en Drs. P precies hetzelfde hoor, het enige verschil is dat jij het de hele tijd over het DNA hebt alsof het enkelstrengs is, terwijl er toch echt dubbelstrengs is (er is een coderende streng en een template streng)

dus als ik jou verhaal af mag maken:

mRNA is een (negatieve) kopie van (de template streng van) het DNA, en dus een positieve kopie van (de coderende streng van) het DNA

tRNA moet dus dezelfde code hebben als het stukje template DNA waarvan het MRNA gekopieerd werd, (dwz weer een negatief van het negatief, oftewel een positief) met dit verschil dat thymine is vervangen door uracil.

maar tRNA is dus een negatieve kopie van de coderende streng...

tenminste zo heb ik het op school geleerd...

Jan van de Velde

uit §3.3 van de cursus:

Daarom moet er, telkens als er een eiwit gebouwd moet worden, een stukje DNA (verantwoordelijk voor dat eiwit) gekopieerd worden. Allereerst wordt het betreffende stukje DNA (verantwoordelijk voor dat eiwit) opengeritst.

Van dat stuk van één van de strengen wordt dan een (negatieve) kopie gemaakt, ongeveer zoals dat ook gebeurde voor de verdubbeling van DNA (zie § 3.1). Dit wordt ook wel 'transcriptie' genoemd.

Dus als ik het goed begrijp zou deze passage duidelijker/vollediger kunnen/moeten ??

Klintersaas

Dus als ik het goed begrijp zou deze passage duidelijker/vollediger kunnen/moeten ??

Inderdaad. Bij het maken van de cursus leek het me niet zo belangrijk om het te vermelden, maar blijkbaar is er toch behoefte aan.

Hurm

Kort gezegd draait het dus allemaal om de template streng. De andere streng is voor het verhaal gans niet interessant.

kasper90

Kort gezegd draait het dus allemaal om de template streng. De andere streng is voor het verhaal gans niet interessant.

Tsja, dat zou je kunnen zeggen, maar in de wetenschap wordt de template streng juist de non-sense streng genoemd, en de coderende streng, de sense streng.

Oftewel, als er een DNA code gemaakt wordt van iets, kijken ze naar de coderende streng, niet naar de template streng. Dus het lijkt me wel ver om te zeggen dat deze streng niet interessant is voor het verhaal

Claudia

Ik heb dit artikel gelezen om dingen duidelijk te krijgen voor een werkstuk dat ik moet maken voor school, en ik moet zeggen dat het voor een forum artikel erg goed en compleet is. De andere forums waar ik ben geweest zag ik met mijn nog niet zo brede kennis over dit soort dingen veel grove fouten. Bijvoorbeeld dat je bij RNA i.p.v. een T een U hebt, dat hadden ze er niet bij staan, en ook in de plaatjes was dit fout gedaan.

Het is lekker in vlotte begrijpbare taal geschreven en door het gebruik van plaatjes werd alles nog duidelijker.

Nu schrijf ik dit natuurlijk niet zomaar, alleen omdat het een supergoed artikel is in mijn ogen:

ik wilde vragen of ik plaatjes mag kopieren voor mijn werkstuk. Natuurlijk komt dan in ieder geval uw artikel in de bronnenlijst te staan.

Groetjes Claudia

Wetenschapsforum

Laatste berichten

Nieuwsberichten

[microcursus] wat is dna? (basis)

[microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)

Re: [microcursus] wat is dna? (basis)