Springen naar inhoud

Sds


  • Log in om te kunnen reageren

#1

Giulia

    Giulia


  • >25 berichten
  • 69 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 22 juni 2008 - 15:53

Hoi, ik had een vraagje ivm SDS. Ik vind op internet nl tegenstrijdige verklaringen.
Is het zo dat SDS er ook voor zorgt dat een multisubunit eiwit uiteenvalt in z'n samenstellende polypeptideketens (die bvb door disulfidebruggen verbonden zijn)?
Als dat zo is, dan snap ik niet echt het nut van eiwitscheiding via SDS-PAGE: als je aan een eiwitmix eerst SDS toevoegt (en eiwitten dus in hun subunits uiteenvallen) en je de mix vervolgens wil scheiden door gelelektroforese, dan zitten je polypeptideketens toch allemaal door elkaar en heb je toch niets aan je scheiding?
Alvast bedankt!
Julie

Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

lucilius

    lucilius


  • >250 berichten
  • 254 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 23 juni 2008 - 14:50

http://en.wikipedia.org/wiki/SDS-PAGE
dit kan al helpen, is redelijk goed en accuraat.

Verder: ik snap je vraag niet volledig.
Bij sds ga je scheiden op basis van grootte (elk eiwit fel negatief geladen, dus allemaal "zelfde" lading). Dat de eiwitten door elkaar zitten, geeft niet. Je gaat ze toch net scheiden? De eiwitten zitten toch sowieso door elkaar?

Wat de invloed van sds is: wat bedoel je juist met een multisubunit?

#3

Giulia

    Giulia


  • >25 berichten
  • 69 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 04 juli 2008 - 16:15

Multisubunit = eiwit dat uit verschillende polypeptideketens bestaat

Misschien eerst dit nog: zijn bij een eiwit dat uit verschillende polypeptideketens bestaat die ketens steeds covalent met elkaar verbonden? Zoja, op welke mogelijke manieren dan (naast disulfidebruggen)?

Ik zal het op een andere manier proberen te formuleren.
Stel: je hebt een eiwitmengsel dat eiwitten bevat die uit verschillende polypeptideketens bestaan (verbonden door disulfidebruggen)
Is het dan zo dat bij toevoeging van SDS die disulfidebruggen (of andere eventuele verbindingen tussen de polypeptideketens) verbroken worden en de verschillende eiwitten dus in hun onderdelen uiteen vallen?
(hier zit eigenlijk mijn probleem)
Alvast bedankt
Julie

#4

Wouter_Masselink

    Wouter_Masselink


  • >5k berichten
  • 8246 berichten
  • VIP

Geplaatst op 18 juli 2008 - 21:15

Kortweg gezegt, ja. Bij SDS-page creer je gelijk geladen peptideketens, welke zijn geliniariseert. Dit zorgt er uiteindelijk voor dat een massa scheiding ontstaat. Voor een eiwit wat uit meerdere subunits bestaat, zal dit resulteren in verschillende fracties.
"Meep meep meep." Beaker

#5

Marko

    Marko


  • >5k berichten
  • 8933 berichten
  • VIP

Geplaatst op 18 juli 2008 - 21:35

Voor de volledigheid: Disulfidebindingen worden daarbij toch niet verbroken? Dus alleen subunits die via H-bruggen of andere niet-covalente interacties verbonden zijn, vallen uiteen(?)

Cetero censeo Senseo non esse bibendum


#6

Wouter_Masselink

    Wouter_Masselink


  • >5k berichten
  • 8246 berichten
  • VIP

Geplaatst op 25 juli 2008 - 12:54

Disulfide bindingen worden ook verbroken bij het uitvoeren van een SDS-page. Echter dit is niet toe te schrijven aan SDS maar aan 2-mercaptoethanol.
"Meep meep meep." Beaker





0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures