BD v3.1 cycle sequencing Kit

Moderator: ArcherBarry

Reageer
Berichten: 61

BD v3.1 cycle sequencing Kit

Weet iemand wat de BigDye Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems) bevat?

Ik weet dat het dNTP's,ddNTP's, een enzym en een buffer bevat, maar ik weet niet welk enzym,buffer en de concentratie's van de bestanddelen

Kan iemand me helpn??

DANK!!

s

Berichten: 740

Re: BD v3.1 cycle sequencing Kit

Het enzym was een speciale amplitaq geloof ik, de concentraties zijn onbekend, dit is alleen bij de Applied Biosystems bekend.

De 3.1 en 1.1 versie bevatten wel verschillen in concentraties, de 1.1 is voor korte sequenties, en is dus iets robuuster. De 3.1 is beter voor lange stukken maar heeft soms wat verlies aan het begin, deze is ook geschikter om heterozygoten te controleren.

Berichten: 8

Re: BD v3.1 cycle sequencing Kit

Wat doen de ddNTP's eigenlijk ?

Berichten: 102

Re: BD v3.1 cycle sequencing Kit

Hier een leuke link: http://www.watisgenomics.nl/genomics/genomics/i000838.html

Daar kan je wel iets mee neem ik aan.

Berichten: 740

Re: BD v3.1 cycle sequencing Kit

ddNTP's stoppen de polymerisatie van de DNA streng (termination).

Doordat er soms een ddNTP wordt ingebouwd ontstaan er strengs van allemaal verschillende lengtes die eindigen met een ddNTP (die gelabeld is met een kleurtje, de Dye).

Bij de ddNTP is de vrije -OH groep niet meer beschikbaar omdat deze is veranderd in een -CH4 groep

Berichten: 8

Re: BD v3.1 cycle sequencing Kit

Thanks voor die link en voor de info die site is echt goed!!

Berichten: 102

Re: BD v3.1 cycle sequencing Kit

Thanks voor die link en voor de info die site is echt goed!!
Graag gedaan :oops:

Reageer