Hoi allemaal,
Ik heb een andere vraag,
Hoe kan ik kiezen of ik uit genomisch DNA isoleert of uit cDNA voor een mutatie analyse?
zijn er verschillen tussen deze 2DNA s en hoe wordt cDNA gemaakt?
Welk DNA moet gebruiken voor de amplifacatie en waarom?
Kun je me mischien helpen?
Laatste berichten
-
08:56
geen minkowski-ruimte toch? Doe ik dit nou fout? 11
-
23:56
[scheikunde] berekeningen labo vitamine c bepaling
-
22:05
projectiel 7
-
21:48
Verschil tussen deze 2 vragen 4
-
19:29
[wiskunde] rode en witte ballen verdelen 8
-
17:23
Rotatie van het heelal 41
-
12:15
Weerfrustratie 5
-
11:55
Muntje opgooien 14
-
21 apr
Reactiviteit silyl enol ethers 1
-
21 apr
Criterium voor vochtretentie
-
21 apr
speciale rel. theorie 5
-
21 apr
Vogels in de stad zijn goede klussers
-
21 apr
Ervaringen met "herontdekkingen" 15
-
20 apr
Herleiden afmetingen vanaf een foto 19
-
20 apr
Stank rotte eieren uit de warmwaterboiler 11
-
20 apr
Nut warmtepomp 18
-
20 apr
Airco bevriezings kans berekenen. 17
-
19 apr
Ik wil studeren via afstandsonderwijs, kennen jullie Tech?
-
18 apr
hall effect in vloeistof gebruiken als stromingssensor 6
-
18 apr
Gezocht: de/een naam voor een getallenrij met een cauchyrij als partieelsommenrij
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
DNA EN cDNA
Moderator: ArcherBarry
Forumregels
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
-
- Berichten: 516
Re: DNA EN cDNA
cDNA staat voor copy DNA of complementair DNA. Eigenlijk is het niet meer dan een kunstmatige kopie van een mRNA streng naar DNA met behulp van een reverse transcriptase.
Er zijn dus geen biochemische verschillen tussen de beide strengen. Bijgevolg kan je ze beiden gebruiken in een PCR amplificatie. Je moet vooral kijken naar de toepassing en het verdere gebruik. Als je 'natuurlijk' DNA gaat amplificeren, dan zitten daar nog introns in en dergelijke. Omdat cDNA afkomstig is van mRNA, zijn die introns er al uitgeknipt. Dat is dan ook makkelijker te gebruiken voor expressies in bijvoorbeeld bacteriële cellen.
Er zijn dus geen biochemische verschillen tussen de beide strengen. Bijgevolg kan je ze beiden gebruiken in een PCR amplificatie. Je moet vooral kijken naar de toepassing en het verdere gebruik. Als je 'natuurlijk' DNA gaat amplificeren, dan zitten daar nog introns in en dergelijke. Omdat cDNA afkomstig is van mRNA, zijn die introns er al uitgeknipt. Dat is dan ook makkelijker te gebruiken voor expressies in bijvoorbeeld bacteriële cellen.
-
- Berichten: 516
Re: DNA EN cDNA
Nog even verder reageren:
Als je een mutatie analyse wil maken, dan kan je ook twee wegen op.
Het is niet altijd zeker dat je gen tot uiting komt, zelfs niet als de cel goed getransformeerd zijn. Daarenboven is het moeilijker om mRNA te isoleren (gezien dat instabieler is) dan om DNA te isoleren. Dus is het meestal niet aangewezen om een mutatie analyse via een mRNA isolatie en dan een cDNA PCR te gaan doen.
Makkelijker lijkt me om het via het genomisch DNA te doen. Dat is makkelijker te isoleren. Gewoon een PCR op doen, en je kan zien of je mutant het gewenste gen bevat of niet.
Maar zoals ik al zei, het is niet omdat het gen er zit, dat het ook tot uiting komt. Als het gen geen duidelijk fenotype veroorzaakt, dan kan je beter niet via deze methode werken en toch kiezen voor een mRNA opzuivering. Als je dan een PCR product kan verkrijgen, dan ben je zeker dat je gen ook tot expressie gekomen is.
Nouja, voor zover ik het zie toch.
Als je een mutatie analyse wil maken, dan kan je ook twee wegen op.
Het is niet altijd zeker dat je gen tot uiting komt, zelfs niet als de cel goed getransformeerd zijn. Daarenboven is het moeilijker om mRNA te isoleren (gezien dat instabieler is) dan om DNA te isoleren. Dus is het meestal niet aangewezen om een mutatie analyse via een mRNA isolatie en dan een cDNA PCR te gaan doen.
Makkelijker lijkt me om het via het genomisch DNA te doen. Dat is makkelijker te isoleren. Gewoon een PCR op doen, en je kan zien of je mutant het gewenste gen bevat of niet.
Maar zoals ik al zei, het is niet omdat het gen er zit, dat het ook tot uiting komt. Als het gen geen duidelijk fenotype veroorzaakt, dan kan je beter niet via deze methode werken en toch kiezen voor een mRNA opzuivering. Als je dan een PCR product kan verkrijgen, dan ben je zeker dat je gen ook tot expressie gekomen is.
Nouja, voor zover ik het zie toch.
