Hallo iedereen,
waarom gaan bij hogere annealingstemperaturen er minder mismatching gebeuren dan wanneer je lagere temperaturen gebruikt?
Ik zou eerder denken dat hoe meer energie (hoe warmer) hoe makkelijker een primer kan binden met een mismatch?
groeten
Laatste berichten
-
00:49
Ervaringen met "herontdekkingen" 11
-
00:37
Rotatie van het heelal 24
-
21:28
hall effect in vloeistof gebruiken als stromingssensor 6
-
17:59
Gezocht: de/een naam voor een getallenrij met een cauchyrij als partieelsommenrij
-
17:28
Casus uit de praktijk: positief test THC 18
-
17 apr
speciale rel. theorie 4
-
17 apr
Vreemde stank in huis 11
-
17 apr
3 vragen over mijn rooskleurige r.berekening H2netGekoppeldeHBrflowbatterij.
-
17 apr
Interpretatie reactie-energie 3
-
17 apr
Logistic equation (Pierre Verhulst,Belgian Mathematician) 5
-
16 apr
vB 9
-
15 apr
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 1
-
15 apr
Python: sockets sluiten 4
-
14 apr
Een eenvoudige logische redenering waarom tijd niet kan bestaan 'daarbuiten' 6
-
14 apr
Hoe kun je op quantumwijze getallen vinden in een rij die kleiner zijn dan getal k 3
-
13 apr
Documentenverdwijnen uit onedrive 1
-
12 apr
Behoud van impulsmoment en energie 5
-
12 apr
INLOG STORING / TIPS 4
-
09 apr
[natuurkunde] systeemgrafen 1
-
05 apr
afbuiging licht rond zware objecten via grondbeginselen relativiteitstheorie 490
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
Primer annealing
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 740
Re: Primer annealing
Bij een lagere temp. zijn de matches dusdanig sterk dat de primer geen probleem heeft om te binden in de aanwezigheid van mismatches. Bij hogere temp. wordt de binding van de matches zwakker, waardoor mismatches ervoor zorgen dat de primer loslaat.
-
- Berichten: 32
Re: Primer annealing
Hallo,
als ik het goed begrijp dan komt het dus gewoon op neer dat een goede match veel "sterker" is dan een mismatch en dat deze dus langer bij hogere temperatuur gebonden blijft.
In feite komt het er gewoon op neer dat je hoe sterker (juister) de binding, hoe meer energie je erin moet steken om ze kapot te maken?
Dat brengt mij tot de volgende vraag: het binden van de primers op het DNA zelf, gebeurt dus ook bij zeer lage temperaturen en daar is dus geen extrerne energie (hitte) voor nodig ?
als ik het goed begrijp dan komt het dus gewoon op neer dat een goede match veel "sterker" is dan een mismatch en dat deze dus langer bij hogere temperatuur gebonden blijft.
In feite komt het er gewoon op neer dat je hoe sterker (juister) de binding, hoe meer energie je erin moet steken om ze kapot te maken?
Dat brengt mij tot de volgende vraag: het binden van de primers op het DNA zelf, gebeurt dus ook bij zeer lage temperaturen en daar is dus geen extrerne energie (hitte) voor nodig ?
-
- Berichten: 740
Re: Primer annealing
Nee, dat zijn idd gewoon waterstofbindingen. Er is alleen energie nodig om ze te verbreken.
Je gebruikt bij PCR dus bij voorkeur een zo hoog mogelijke annealing temperatuur zodat de kans op onspecifieke producten zo klein mogelijk is.
Je gebruikt bij PCR dus bij voorkeur een zo hoog mogelijke annealing temperatuur zodat de kans op onspecifieke producten zo klein mogelijk is.
-
- Berichten: 245
Re: Primer annealing
Is de hoogte van de temperatuur die je kunt gebruiken ook afhankelijk van hoeveel G-C rijke gebieden er zijn? Aangezien de basen G-C drie waterstofbruggen vormen en A-T maar twee? En is het dan ook zo dat je veel meer kans op mismatches hebt met primers die veel A en T bevatten? Of denk ik nu verkeerd?
-
- Berichten: 83
Re: Primer annealing
De hoogte van de annealing temperatuur is inderdaad afhankelijk van de hoeveeleid G-C
