Hallo allemaal,
Ik heb een bepaald component (wat het is doet er effe niet toe voor de vraag) en die heb ik gemeten met de LC/MS hierbij heb ik het component gemeten als ongelabeld en ook als gelabeld met Koolstof-13. Nu wil ik weten hoeveel is er daadwerkelijk gelabeld. Ik heb hier een aantal methodes waarmee het gedaan wordt maar elke van hen leveren een andere antwoord op :S . Weet iemand misschien hoe dit gaat?
Laatste berichten
-
00:38
Logistic equation (Pierre Verhulst,Belgian Mathematician) 5
-
00:07
Casus uit de praktijk: positief test THC 11
-
19:47
vB 9
-
15:02
Interpretatie reactie-energie 2
-
15 apr
Vreemde stank in huis 9
-
15 apr
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 1
-
15 apr
Python: sockets sluiten 4
-
14 apr
Een eenvoudige logische redenering waarom tijd niet kan bestaan 'daarbuiten' 6
-
14 apr
Hoe kun je op quantumwijze getallen vinden in een rij die kleiner zijn dan getal k 3
-
13 apr
Rotatie van het heelal 22
-
13 apr
Documentenverdwijnen uit onedrive 1
-
12 apr
Behoud van impulsmoment en energie 5
-
12 apr
INLOG STORING / TIPS 4
-
09 apr
[natuurkunde] systeemgrafen 1
-
05 apr
afbuiging licht rond zware objecten via grondbeginselen relativiteitstheorie 490
-
05 apr
Ongepaste reclame 179
-
04 apr
Gegevens wissen mobiel 6
-
04 apr
Geiger Muller telbuis 2
-
03 apr
Schroefdraad berekening 3
-
03 apr
Relatieve luchtvochtigheid 26
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
percentage gelabeld
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 157
Re: percentage gelabeld
Geef eens wat meer informatie. Welke methodes?
Gaat het om een monster of gekochte standaard "normaal" of "gelabeld"
Wat vind jij een ander antwoord. bv 0,1% verschil of 50% verschil.
Normaal gesproken is zo'n methode met MS heel makkelijk. De gelabelde standaard heeft een andere massa. Dus je meet de 12C en de 13C massa tov een 12C en 13C standaard en dan kan je het percentage uitrekenen.
Gaat het om een monster of gekochte standaard "normaal" of "gelabeld"
Wat vind jij een ander antwoord. bv 0,1% verschil of 50% verschil.
Normaal gesproken is zo'n methode met MS heel makkelijk. De gelabelde standaard heeft een andere massa. Dus je meet de 12C en de 13C massa tov een 12C en 13C standaard en dan kan je het percentage uitrekenen.
-
- Berichten: 39
Re: percentage gelabeld
het gaat om een molecule dat zoeen 20 koolstof atomen bevat. We gebruiken een specifieke labeling methode waardoor alleen 8 atomen gelabeled wordt. Het verschil dat ik vind is zoeen 5% dat vind ik nogal wat, in sommige gevallen is het zelfs meer.
Wat we hebben gedaan is 2 spectra's opgemeten met LC/MS 1 van de ongelabelde en 1 van de gelabelde molecuul. Het gene wat ik naar opzoek ben is het liefst een boek of iets waar het goed in staat uitgelegd. Zodat ik weet dat dit de juiste methode is
De methodes die ik nu heb hebben geen referentie erbij staan en daarom vertrouw ik het niet.
Wat we hebben gedaan is 2 spectra's opgemeten met LC/MS 1 van de ongelabelde en 1 van de gelabelde molecuul. Het gene wat ik naar opzoek ben is het liefst een boek of iets waar het goed in staat uitgelegd. Zodat ik weet dat dit de juiste methode is
De methodes die ik nu heb hebben geen referentie erbij staan en daarom vertrouw ik het niet.
-
- Berichten: 157
Re: percentage gelabeld
Als ik het goed begrijp maak je dus zelf het galabelde molecuul.
Meet je de zelf gemaakte gelabelde oplossing meerdere keren en geeft dat 5% verschil of meet je verschillende zelf gemaakte oplossingen 1x en zit er 5% onderling verschil tussen de oplossingen.
Dan zou het aan het rendement van de opwerkingsmethode kunnen liggen en is 5% niet echt veel.
En hoe heb je het gehalte dan uitgerekend?
Meet je de zelf gemaakte gelabelde oplossing meerdere keren en geeft dat 5% verschil of meet je verschillende zelf gemaakte oplossingen 1x en zit er 5% onderling verschil tussen de oplossingen.
Dan zou het aan het rendement van de opwerkingsmethode kunnen liggen en is 5% niet echt veel.
En hoe heb je het gehalte dan uitgerekend?
-
- Berichten: 39
Re: percentage gelabeld
Het probleem is dat de 2 methoden waarmee het gelabelde percentage berekend worden al 5% verschillen en er is geen referentie bij toegevoegd (dus niet een 5% verschil door een synthese stap ofzo, puur aan de manier van het verwerken van de data).
Waar ik dus naar op zoek ben is de manier waarop de gelabelde percentage berekend kan worden m.b.v. massaspectrometrie.
Wat ik tot nu toe ben tegengekomen is dat ze de verhouding nemen van koolstof-12 en 13 in zowel het gelabeld spectrum als het ongelabeld spectrum en dat dan verder verwerken. Dat kan ik allemaal wel begrijpen maar als voorbeeld laten ze het alleen zien met 1 gelabeld atoom en niet zoals wat ik heb 8 gelabeld atomen.
Waar ik dus naar op zoek ben is de manier waarop de gelabelde percentage berekend kan worden m.b.v. massaspectrometrie.
Wat ik tot nu toe ben tegengekomen is dat ze de verhouding nemen van koolstof-12 en 13 in zowel het gelabeld spectrum als het ongelabeld spectrum en dat dan verder verwerken. Dat kan ik allemaal wel begrijpen maar als voorbeeld laten ze het alleen zien met 1 gelabeld atoom en niet zoals wat ik heb 8 gelabeld atomen.
-
- Berichten: 157
Re: percentage gelabeld
Als je het op die manier wilt uitrekenen, moet je het helemaal uitschrijven. Ik weet niet of je ooit les hebt gehad in massa spectrometrie, maar als je de isotoop verhouding wilt uitrekenen, moet je het zo doen. Ik zal 2 voorbeelden geven:
Stel je massa van je molecuul is 200 met 2 chloor atomen. Je krijgt dan een totale massa van 270 (met 2 35Cl , 272 (met 1 35Cl en 1 37Cl) en 274 (met 2 37Cl.
35Cl en 37Cl verhouding 3:1
Met 2 chloor
Cl---Cl---verhouding
35--35---3 * 3 = 9
35--37---3 * 1 = 3
37--35---3 * 1 = 3
37--37---1 * 1 = 1
De 35:37 en 37:35 moet je bij elkaar optellen. De totale verhouding wordt dus 9:6:1
met 3 chloor
Cl---Cl---Cl---verhouding
35--35---35---3 * 3 * 3 = 27
35--35---37---3 * 3 * 1 = 9*
35--37---35---3 * 1 * 3 = 9*
37--35---35---1 * 3 * 3 = 9*
35--37---37---3 * 1 * 1 = 3#
37--35---37---1 * 3 * 1 = 3#
37--37---35---1 * 1 * 3 = 3#
37--37---37---1 * 1 * 1 = 1
De * en # weer bij elkaar optellen, omdat deze dezelfde massa hebben, dus 27:27:9:1
Hopelijk is het zo een beetje duidelijk. De streepjes kun je lezen als spaties voor afstand.
met 20 koolstof atomen (waarvan 8 gelabeld) is het hetzelfde, maar dat is zoveel werk, dat mag je zelf doen
Misschien is hier wel een formule voor om dit uit te rekenen, maar dat zou ik zo niet weten.
btw. De verhouding 12C :13C is 99:1.
Je snapt dus al dat als je 8 "gelabelde" koolstofatomen hebt, de intensiteit van die massapiek erg klein wordt tov de ongelabelde massa.
Bij 2 gelabelde atomen is dit 1/(9+6) = 1/15 en bij 3 gelabelde atomen is dit al 1/(27+27+9) = 1/63.
Gaat dit natuurlijk niet helemaal op, omdat jij 8 van de 20 koolstof atomen gelabeld hebt, maar dat is weer een ander verhaal.
Dus ik denk dat 5% afwijking niet heel veel is bij zo'n lage verhouding.
Maar zoals ik al eerder zei. Normaal gesproken wordt het monster gemeten tov een normale en een gelabelde standaard.
Stel je massa van je molecuul is 200 met 2 chloor atomen. Je krijgt dan een totale massa van 270 (met 2 35Cl , 272 (met 1 35Cl en 1 37Cl) en 274 (met 2 37Cl.
35Cl en 37Cl verhouding 3:1
Met 2 chloor
Cl---Cl---verhouding
35--35---3 * 3 = 9
35--37---3 * 1 = 3
37--35---3 * 1 = 3
37--37---1 * 1 = 1
De 35:37 en 37:35 moet je bij elkaar optellen. De totale verhouding wordt dus 9:6:1
met 3 chloor
Cl---Cl---Cl---verhouding
35--35---35---3 * 3 * 3 = 27
35--35---37---3 * 3 * 1 = 9*
35--37---35---3 * 1 * 3 = 9*
37--35---35---1 * 3 * 3 = 9*
35--37---37---3 * 1 * 1 = 3#
37--35---37---1 * 3 * 1 = 3#
37--37---35---1 * 1 * 3 = 3#
37--37---37---1 * 1 * 1 = 1
De * en # weer bij elkaar optellen, omdat deze dezelfde massa hebben, dus 27:27:9:1
Hopelijk is het zo een beetje duidelijk. De streepjes kun je lezen als spaties voor afstand.
met 20 koolstof atomen (waarvan 8 gelabeld) is het hetzelfde, maar dat is zoveel werk, dat mag je zelf doen
Misschien is hier wel een formule voor om dit uit te rekenen, maar dat zou ik zo niet weten.btw. De verhouding 12C :13C is 99:1.
Je snapt dus al dat als je 8 "gelabelde" koolstofatomen hebt, de intensiteit van die massapiek erg klein wordt tov de ongelabelde massa.
Bij 2 gelabelde atomen is dit 1/(9+6) = 1/15 en bij 3 gelabelde atomen is dit al 1/(27+27+9) = 1/63.
Gaat dit natuurlijk niet helemaal op, omdat jij 8 van de 20 koolstof atomen gelabeld hebt, maar dat is weer een ander verhaal.
Dus ik denk dat 5% afwijking niet heel veel is bij zo'n lage verhouding.
Maar zoals ik al eerder zei. Normaal gesproken wordt het monster gemeten tov een normale en een gelabelde standaard.
-
- Berichten: 39
Re: percentage gelabeld
mhh ik zal het proberen wat beter uit te leggen wat ik bedoel. Mijn molecuul is gesynthetiseerd met een stabile isotoop dus 13C inplaats van 12C. Maar alle chemicalien die ik gebruikt heb zijn niet allemaal 13C want dat zo te duur zijn. Dus oftewel ik meet niet op "natural abundance" maar met een gelabeld molecuul. Dus mijn verhouding van 12C op 13C is niet 98.9%:1.1% maar 60:40 % b.v.
Het gene wat ik dus wil weten is hoeveel van mijn koolstof atomen daadwerklijk 13C zijn. Wanneer ik dit op de ene methode bereken zegt deze dat 20% gelabeld is. Dus van al mijn koolstof atomen die ik heb geprobeerd te labelen zou 20% 13C zijn. De andere berekening zegt dat het 15% is. Dit is voormij wel een groot verschil.
Het gene wat ik dus wil weten is hoeveel van mijn koolstof atomen daadwerklijk 13C zijn. Wanneer ik dit op de ene methode bereken zegt deze dat 20% gelabeld is. Dus van al mijn koolstof atomen die ik heb geprobeerd te labelen zou 20% 13C zijn. De andere berekening zegt dat het 15% is. Dit is voormij wel een groot verschil.
