Ik vroeg mij af hoe je op deze vraag antwoordt:
"Leg uit waar de positieve aminozuren en de negatieve aminozuren zich in een transmembranaire helix bevinden aan de hand van de structuur van de alfa-helix en de structuur van de membraan."
Wat ik dus zou antwoorden, maar ben er dus niet zeker van of het klopt:
Als je eerst naar een alfa-helix kijkt, weet je dat er een globaal dipoolmoment wordt gecreëerd door de H-bruggen tussen -NH en C=O groepen van de polypeptideruggengraat; N-terminus is de positieve zijde en de C-terminus de negatieve zijde. Dit wordt respectievelijk vaak door een glutamine (negatieve lading) en minder vaak door een lysine (positieve lading) gecompenseerd.
Om efficient in de lipidemembraan te passen moeten er hydrofobe AZ aanwezig zijn in het transmembranaire deel van de helix, zodat het geheel stabiel blijft door middel van hydrofobe interacties en Vander Waals interacties, en geladen AZ aan de gedeelten die met de polaire groepen van de lipiden interageren. Nu weten we ook dat neutrale/negatieve fosfolipiden de intracellulaire zijde van de membraan opbouwen en de cholinebevattende fosfolipiden (i.e postief geladen) en glycolipiden de extracellulaire zijde opbouwen.
Dus door de aanwezigheid van de negatieve Gln residus aan de N terminus zal deze naar de extracellulaire zijde gericht zijn, en de C terminus naar de intracellulaire zijde.
Graag wat feedback
Alvast bedankt!
Laatste berichten
-
22:54
Herleiden afmetingen vanaf een foto 12
-
18:53
Ik wil studeren via afstandsonderwijs, kennen jullie Tech?
-
18:09
Rotatie van het heelal 32
-
17:19
Ervaringen met "herontdekkingen" 12
-
18 apr
hall effect in vloeistof gebruiken als stromingssensor 6
-
18 apr
Gezocht: de/een naam voor een getallenrij met een cauchyrij als partieelsommenrij
-
18 apr
Casus uit de praktijk: positief test THC 18
-
17 apr
speciale rel. theorie 4
-
17 apr
Vreemde stank in huis 11
-
17 apr
3 vragen over mijn rooskleurige r.berekening H2netGekoppeldeHBrflowbatterij.
-
17 apr
Interpretatie reactie-energie 3
-
17 apr
Logistic equation (Pierre Verhulst,Belgian Mathematician) 5
-
16 apr
vB 9
-
15 apr
Kunnen quantum Zonnecellen 190% quantum efficiënt zijn 1
-
15 apr
Python: sockets sluiten 4
-
14 apr
Een eenvoudige logische redenering waarom tijd niet kan bestaan 'daarbuiten' 6
-
14 apr
Hoe kun je op quantumwijze getallen vinden in een rij die kleiner zijn dan getal k 3
-
13 apr
Documentenverdwijnen uit onedrive 1
-
12 apr
Behoud van impulsmoment en energie 5
-
12 apr
INLOG STORING / TIPS 4
Nieuwsberichten
-
04 mar
Een nieuw soort magnetisme: altermagnetisme
-
31 okt
AI kan via stem diabetes vaststellen 11
-
21 okt
Einstein krijgt wéér gelijk 45
-
07 feb
witter dan wit 20
-
19 jun
irrigatie en de aardas
Biochemie: alfa-helices en lipidemembranen
Moderator: ArcherBarry
-
- Berichten: 6.853
Re: Biochemie: alfa-helices en lipidemembranen
Dit is vast niet wat men bedoelt.
Als je naar een membraan kijkt zonder eiwit erin, zitten daar dan ladingen in? Of andere polaire groepen? Zo ja, waar?
Als je naar een membraan kijkt zonder eiwit erin, zitten daar dan ladingen in? Of andere polaire groepen? Zo ja, waar?
-
- Berichten: 57
Re: Biochemie: alfa-helices en lipidemembranen
Membraan = lipidendubbellaag, bovenste laag naar extracellulair gericht en onderste laag naar intracellulair. Extracellulaire laag bestaat uit glycolipiden en positief geladen fosfolipiden. Intracellulaire laag bestaat uit negatief geladen en neutrale fosfolipiden. Ladingen zitten op de 'koppen', de staarten bestaan uit hydrofobe ongeladen vetzuurketens...alé, zo staat dat toch in mijn cursus.
-
- Berichten: 6.853
Re: Biochemie: alfa-helices en lipidemembranen
Volgens mij ben je al een heel end. Zou een polair gedeelte van het eiwit zich erg prettig voelen tussen die ongeladen vetzuurketens?Thomas93 schreef: ↑zo 27 jan 2013, 17:56
Ladingen zitten op de 'koppen', de staarten bestaan uit hydrofobe ongeladen vetzuurketens
-
- Berichten: 57
Re: Biochemie: alfa-helices en lipidemembranen
Neen, uiteraard niet. Dat zei ik ook al (misschien was het niet duidelijk genoeg uit mijn eerste uitleg, excuses hiervoor)
Ik denk dus dat de Alfa-helix dus zal bestaan 1) hydrofobe (ongeladen) aminozuren die met de ongeladen vetzuurketens interageren, en 2) polaire (geladen) aminozuren aan de 'uiteinden', om met de polaire koppen te interageren.
Ik denk dus dat de Alfa-helix dus zal bestaan 1) hydrofobe (ongeladen) aminozuren die met de ongeladen vetzuurketens interageren, en 2) polaire (geladen) aminozuren aan de 'uiteinden', om met de polaire koppen te interageren.
-
- Berichten: 6.853
Re: Biochemie: alfa-helices en lipidemembranen
Sorry, inderdaad is die ene zin de essentie van het geheel, ik had dat in je hele verhaal bovenin gemist. Je aanvulling over positieve en negatieve ladingen en dipool-richting van de helix is niet juist: veel transmembraan-eiwitten gaan verschillende malen heen-en-weer, en elke volgende helix zit dan andersom. Wel is dus elke keer het transmembraanstuk apolair aan de buitenkant van het eiwit, en dat is niet typisch voor andere eiwitten: bij eiwitten die vrij bewegen in het cytoplasma zitten aan de buitenkant veel polaire residuen en wordt de vouwing vaak gedreven door de hydrofobe residuen in de kern van het eiwit tegen elkaar te leggen.
