SAGE (serial analysis of gene expression)
Moderator: ArcherBarry
- Berichten: 252
SAGE (serial analysis of gene expression)
Hallo allemaal,
In een SAGE, wordt het cDNA na binding aan streptavidine, gehalveerd en dan aan casettes geligeerd. Waarom moet men het cDNA halveren?
In bijlage een afbeelding van de verschillende stappen.
In een SAGE, wordt het cDNA na binding aan streptavidine, gehalveerd en dan aan casettes geligeerd. Waarom moet men het cDNA halveren?
In bijlage een afbeelding van de verschillende stappen.
- Berichten: 3.963
Re: SAGE (serial analysis of gene expression)
In theorie zou je het ook kunnen doen zonder te knippen, maar daardoor wordt het enkel omslachtiger.
Die kleine stukjes cDNA zijn immers meer dan voldoende om een uniek mRNA te identificeren [doi]10.1126/science.270.5235.484[/doi]. Als tweede belangrijk punt moet je na het concatameren je tags nog sequeneren. Sequeneren gaat efficiënt voor kleine constructen en als je met kleine tags werkt kan je gewoon veel meer informatie uit één fragment halen in vergelijking met grote fragmenten.
Die kleine stukjes cDNA zijn immers meer dan voldoende om een uniek mRNA te identificeren [doi]10.1126/science.270.5235.484[/doi]. Als tweede belangrijk punt moet je na het concatameren je tags nog sequeneren. Sequeneren gaat efficiënt voor kleine constructen en als je met kleine tags werkt kan je gewoon veel meer informatie uit één fragment halen in vergelijking met grote fragmenten.
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill