Aurelia schreef: ↑za 01 mar 2014, 14:43
De gekoppelde herhalingen worden gesplitst in tandem herhaalde sequenties en genen clusters voor ribosomale RNAs. Wat zijn genenclusters voor ribosomaal RNA, wat moet ik me erbij voorstellen? Kan iemand hier meer uitleg over geven aub?
Genen die voor ribosomaal DNA coderen zijn in tandem repeat achter elkaar gelegen. Bij hogere eukaryoten kunnen dat 100-en kopijen zijn en bij de mens loopt dit zelfs op tot 400 repeats gelegen op 5 verschillende chromosomen. Iedere repeat wordt gescheiden van de volgende door een non-transcribed spacer (NTS) die controle signalen bevat voor de transcriptie. Door al die repeats worden er gigantische hoeveelheden rRNA geproduceerd (zie figuur). Om dit even in perspectief te plaatsen; bij zoogdieren staat de rDNA transcriptie in voor 35-65% van de totale transcriptie!
- germ21p.GIF (67.39 KiB) 657 keer bekeken
- 11.12.jpg (22.33 KiB) 658 keer bekeken
Vervolgens worden de niet gekoppelde (of verspreide) herhaalde sequenties ook opgesplitst in LINE en SINE. Deze SINE en LINE snap ik ook niet, iemand die mij deze begrippen zou kunnen uitleggen aub?
LINE en SINEs zijn retrotransposons die op willekeurige plaatsen in het humaan genoom gelegen zijn. LINEs zijn Long Interspersed Elements and SINEs zijn Short Interspersed Elements. LINEs lijken op retrotransposons en bezitten een reverse transcriptase in hun ORF, maar missen de LTR die typisch zijn voor een "echt" retrotranspon. Als gevolg van het reverse transcriptase kan de transpositie bij LINES dus autonoom gebeuren.
In tegenstelling tot LINEs bezitten SINEs geen reverse transcriptase en deze zijn dus bijgevolg niet autonoom. Misschien een weetje is dat de meest abundante SINE in het humane genoom
Alu wordt genoemd. De naam is afkomstig omdat deze een targetsite bevat voor het restrictie-enzym Alu.
Tot slot heb ik ook gevonden dat 45% van ons volledig genoom afkomstig is van (retro)transposons maar wat zijn dit?
Tansposons zijn stukken DNA die van positie kunnen wisselen in genoom. Maar eigenlijk is dit een heel algemene vraag. Als je bovenstaande vragen stelt neem ik aan dat je ook basis van transposons hebt gezien, misschien moet je daar eens naar terugkijken? Eventueel kan je ook een kijkje nemen op:
http://en.wikipedia....wiki/Transposon
http://nl.wikipedia....i/Springend_gen
Als je nog specifieke vragen hebt ben je zeker welkom!
"Success is the ability to go from one failure to another with no loss of enthusiasm" - Winston Churchill
