[biologie] DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

Moderators: ArcherBarry, Fuzzwood

Reageer
Gebruikersavatar
Berichten: 236

DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

Ik heb zonet een test afgelegd en mijn leerstof werd bij de eerste vraag al serieus in twijfel getrokken.
 
Ik heb namelijk geleerd en begrepen dat de transcriptie en translatie zich telkens complementair voltrekken, maw:
 
DNA:
 
3' CAC AAC TTT 5'
 
mRNA
5' GUG UUG UUU 3'
 
tRNA met de complementair anticodon, beginnend van 5'
 
CAC met AZ "His"
daarna AAC met AZ "Asn"
daarna AAA met AZ "Lys"
 
Maar bij het maken van de test, zag ik een multiple choice vraag met ongeveer dezelfde vraag. Enkel kwam ik op deze methode geen antwoord uit, maar ik kwam wel een antwoord uit als ik de mRNA direct koppelde met de AZ'n. Dus de mRNA codeert voor de AZ-sequentie, niet de complementaire basenvolgorde op de tRNA?
 
Ik heb namelijk een andere open vraag ook volledig uitgewerkt met de versie die ik last minute heb aangepast. Dus dat mRNA codeert voor de AZ'n, niet de anticodon? Klopt dit zo?

Gebruikersavatar
Berichten: 236

Re: DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

In bijlage is een voorbeeld, als iemand mij hiermee kan helpen?
 
Welk van onderstaande sequenties van de DNA-keten werd gebruikt als template voor de  synthese van m-RNA dat codeert voor volgend peptide?
 
 
<b>Met-Arg-Cys-Tyr-Arg-Cys-Met</b>
 
Antwoorden:


5'.....TTTACTCTACAATATCTACATACAA.....3'


5'.....AAATGAGATGTTATAGATGTATGTT.....3'


3'.....AAATGAGATGTTATAGATGTATGTT....5'


3'.....TTTACTCTACAATATCTACATACAA.....5'

 
Bijlagen
DNA_RNA_oefng.png
DNA_RNA_oefng.png (165.92 KiB) 512 keer bekeken

Gebruikersavatar
Berichten: 967

Re: DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

Opmerking moderator

Dit onderwerp past beter in het huiswerkforum en is daarom verplaatst.
 
Ja, tRNA bevat complementaire anticodons die daarmee op complementaire mRNA sequenties passen. Ik zie verder geen duidelijke vraag m.b.t. tRNA, terwijl je titel dat wel suggereert?!
 
Wat betreft je tweede vraag:
Je moet goed onthouden dat de coding strand van DNA 5'-naar-3' is. Vervolgens heb je een complementaire strand, de template strand die van 3'-naar-5' verloopt. Vanaf die template strand vindt de transcriptie plaats. Je krijgt dan een mRNA strand van 5'-naar-3'. 
 
Als je dan naar het eerste aminozuur kijkt, methionine (Met). Je weet, aan de hand van de tabel, wat het codon voor methionine is in mRNA: AUG. Je weet ook, aangezien mRNA van 5'-naar-3' geproduceerd wordt, dat dit dus 5'-AUG-3' is. Welke codons heb je dan in de template en coding strand van het DNA? Als je antwoord kunt geven op die vraag, vallen er al direct 2 antwoorden af.
 
Vervolgens kun je kijken naar het derde aminozuur, cysteïne (Cys). Arginine (Arg) slaan we even over, want daar heb je 6 verschillende codons van, terwijl cysteïne er maar 2 heeft. Ontrafel het codon van dat aminozuur op dezelfde manier. Dan blijft er één antwoord over.
"In biotech moet je soms dingen doen waarvan anderen zeggen dat het onmogelijk is."

Henri A. Termeer (1946-2017)

Gebruikersavatar
Berichten: 236

Re: DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

Ja, mijn vraag was dus;

Stel het DNA is 3-CAC-5

Dan is het mRNA toch 5-GUG-3

Vervolgens begrijp ik dat tRNA met de complementair anticodon, begint op

mRNA 5-GUG-3

Anticodon is dan CAC (op tRNA), ik zocht dus de CAC van het tRNA in de tabel. En deze komt overeen met AZ "His".

Maar eigenlijk is het de mRNA 5-GUG-3 die ik moet opzoeken met overeenkomend AZ. En dit is dan AZ "Val". Klopt dit?

Dus AZ wordt gelinkt aan de mRNA, niet de tRNA.

Gebruikersavatar
Berichten: 236

Re: DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

Wat betreft de oefening, als ik mijn bovenstaand kennis gebruik dan neem ik dus

Methionine (op tRNA) heeft anticodon AUG. Dit anticodon koppelt op de complementaire mRNA (5-UAC-3). <- hier maak ik dus de fout, en ik zou hier graag bevestiging van willen.

Dit anticodon koppelt op mRNA 5-UAC-3, en dit stukje mRNA komt overeen met DNA 3-ATG-5

Maar eigenlijk is het aminozuur Methionine helemaal niet direct identificeerbaar met de anticodon tRNA?

Als je dus een aantal tRNA's krijgt met de anticodons en je moet de AZ achterhalen dan moet je eerst de complementaire mRNA stukje zoeken. <- Zo snapte ik het nog niet.

Methionine (AZ tRNA)

5-AUG-3 (op mRNA)

3-TAC-5 (op DNA) of 5-CAT-3

Begrijp ik het zo goed?

Gebruikersavatar
Berichten: 967

Re: DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

ABTTh schreef: Stel het DNA is 3-CAC-5

Dan is het mRNA toch 5-GUG-3
 
Klopt.
 
mRNA 5-GUG-3
Anticodon is dan CAC (op tRNA), ik zocht dus de CAC van het tRNA in de tabel. En deze komt overeen met AZ "His".
 
Complementaire codon op het tRNA zal dan inderdaad CAC zijn. 
 
Je verdere redenatie klopt alleen niet. De translatie gaat simpelweg als volgt: het mRNA wordt door het ribosoom getrokken en daar worden de codons na de methionine 'afgelezen'. Vervolgens heb je plekken in het ribosoom waar tRNA's kunnen binden. Dit gaat op basis van trial-and-error, dus het is wachten tot de juiste tRNA op de juiste codon 'plakt'. Vervolgens krijg je een scheikundige reactie en wordt het aminozuur, wat gebonden is aan die tRNA, verbonden met het vorige aminozuur. Dat start dus met methionine en gaat net zo lang door tot het ribosoom het 'stopcodon' tegenkomt.
 
Met andere woorden: die tabel is gebaseerd op mRNA, niet tRNA.
 
ABTTh schreef: Methionine (op tRNA) heeft anticodon AUG. Dit anticodon koppelt op de complementaire mRNA (5-UAC-3). <- hier maak ik dus de fout, en ik zou hier graag bevestiging van willen.

Dit anticodon koppelt op mRNA 5-UAC-3, en dit stukje mRNA komt overeen met DNA 3-ATG-5

Maar eigenlijk is het aminozuur Methionine helemaal niet direct identificeerbaar met de anticodon tRNA?

Als je dus een aantal tRNA's krijgt met de anticodons en je moet de AZ achterhalen dan moet je eerst de complementaire mRNA stukje zoeken. <- Zo snapte ik het nog niet.
 
 
Nee, methionine wordt gebonden in het ribosoom als deze het 5'-AUG-3' codon op het mRNA tegenkomt. Het tRNA anticodon (Met-tRNA) is dan dus 3'-UAC-5'. 
 
5-AUG-3 (op mRNA)

3-TAC-5 (op DNA) of 5-CAT-3

Begrijp ik het zo goed
 
Ja, dit doe je dan weer wel goed.
 
Tip: lees nog eens door hoe de translatie globaal werkt en onthoud dat de tabel de mRNA codons betreft. tRNA is slechts een transporter van aminozuren.
"In biotech moet je soms dingen doen waarvan anderen zeggen dat het onmogelijk is."

Henri A. Termeer (1946-2017)

Gebruikersavatar
Berichten: 236

Re: DNA naar mRNA naar tRNA (polypeptide) of DNA naar mRNA (polypeptide)

Ok, dank u wel. Dat is duidelijk.

Ik zal dit wijzigen in mijn notitieboek. De rest van het verhaal begrijp ik wel, het ging me enkel om de translatie. Ik zat daar vast met die terugkoppeling van mRNA op tRNA.

Reageer