Springen naar inhoud

Smeltcurve analyse DNA fragment.



  • Log in om te kunnen reageren

#1

Val232rio Cosemans

    Val232rio Cosemans


  • >250 berichten
  • 390 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 19 maart 2018 - 08:39

Dag iedereen

Op school gaan we in het labo een qPCR uitvoeren op een DNA staal om te zien welk genotype van HPV aanwezig is.
Ter voorbereiding moeten we een hele reeks vragen oplossen. 
Ik loop een beetje vast bij de volgende vraag:

"In de theorieles hebben we gezien dat de Ct-waarde een maat is voor de hoeveelheid van een specifiek DNA fragment aanwezig in een staal. Maar ook de smeltcurves geven ons in dit experiment informatie over welk genotype van HPV aanwezig is in het staal. Verklaar waarom analyse van de smeltcurves onze dergelijk info op levert."



De gebruikte primers zijn GP5+/GP6+ primers

DIt is mijn beredenering: Indien homozygoot ( +  of - ) dan wordt maar 1 specifiek amplicon gemaakt. Op de grafiek van de eerste afgeleide van fluorescentie ifv temperatuur zie ik dan 1 piek. Indien heterozygoot dan worden 2 amplicons gemaakt. Op de grafiek van de eerste afgeleide van fluorescentie ifv temperatuur zie ik dan 2 pieken.


Klopt dit? Of zie ik iets over het hoofd?


Groetjes

Valerio

 


Dit forum kan gratis blijven vanwege banners als deze. Door te registeren zal de onderstaande banner overigens verdwijnen.

#2

Daaf

    Daaf


  • >100 berichten
  • 195 berichten
  • Ervaren gebruiker

Geplaatst op 19 maart 2018 - 18:29

Dag Valerio,

 

Dat is idd wat je gaat ontdekken in de smeltcurve-analyse, als alles goed verloopt. Weet je ook waarom? Ik veronderstel dat je een niet-specifiek label gaat gebruiken (welk?).







Also tagged with one or more of these keywords: biologie

0 gebruiker(s) lezen dit onderwerp

0 leden, 0 bezoekers, 0 anonieme gebruikers

Ook adverteren op onze website? Lees hier meer!

Gesponsorde vacatures

Vacatures