3-D structuur fusie-eiwit

Moderator: ArcherBarry

Forumregels
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
Reageer
Gebruikersavatar
Berichten: 8.557

3-D structuur fusie-eiwit

Is er een manier om de 3-D structuur van een fusie-eiwit te bepalen met alleen de aminozuur sequentie en de 3-D structuur van de afzonderlijke eiwitten?
"Meep meep meep." Beaker

Gebruikersavatar
Berichten: 808

Re: 3-D structuur fusie-eiwit

Nee,

Er kan alleen een theoretisch model gemaakt worden.

Vaak ligt deze heel dicht bij de werkelijkheid maar zeker weten doe je het nooit zonder het eiwit te maken en te meten.

Gebruikersavatar
Berichten: 8.557

Re: 3-D structuur fusie-eiwit

Met welke computer programma's is dit theoretische model te maken?
"Meep meep meep." Beaker

Gebruikersavatar
Berichten: 808

Re: 3-D structuur fusie-eiwit

Geen idee, het eiwit dat ik probeer te kristalliseren is al jaren geleden voorspeld aan de hand van soortgelijke eiwitten.

Welk programma ze daarvoor gebruikt hebben zou ik echt niet weten.

Ik weet alleen dat dit theoretische model bijna niet gebruikt wordt en men nog steeds wacht tot eindelijk de kristal structuur bekend is.

Maarja, dit eiwit is nou niet bepaald 1 van de makkelijkste.

Gebruikersavatar
Berichten: 8.557

Re: 3-D structuur fusie-eiwit

Heb inmiddels even op het net gezocht, www.expasy.ch/tools/ geeft redelijk wat interessante links. Even verder zoeken.

EDIT: nog steeds niets nuttigs gevonden. Is het mogelijk om in PDB viewer de aminozuursequentie in te voeren en deze dan in 3D weer te laten geven?
"Meep meep meep." Beaker

Reageer