Verwijderen van Fe-ionen uit DNA Samples

Moderator: ArcherBarry

Forumregels
(Middelbare) school-achtige vragen naar het forum "Huiswerk en Practica" a.u.b.
Zie eerst de Huiswerkbijsluiter
Reageer
Berichten: 2

Verwijderen van Fe-ionen uit DNA Samples

Hallo,
Voor een onderzoek op school hebben wij onlangs een PCR uitgevoerd voor bacteriën op bepaalde materialen. De samples van een van deze dragermaterialen bleek geen amplificatie te vertonen, en na verder onderzoek bleek het voor ~10% uit ijzer te bestaan. Aangezien dit een bekende PCR remmer is denken wij dat dit de oorzaak is dat er geen amplificatie werd waargenomen.
Nu zijn wij van plan de PCR nogmaals uit te voeren, maar de monsters eerst te zuiveren van Fe-ionen, heeft iemand een idee over wat de beste methode zou zijn om de DNA-samples hiervan te zuiveren?

Alvast bedankt!

Berichten: 2

Re: Verwijderen van Fe-ionen uit DNA Samples

Het materiaal bevat ook nog aluminium, calcium, nickel, zinc en koper, welke ook PCR remmend kunnen werken. Dus als de gezochte methode deze ook verwijderd zou dit ideaal zijn.

Gebruikersavatar
Berichten: 8.557

Re: Verwijderen van Fe-ionen uit DNA Samples

In plaats van dat je specifieke ionen gaat verwijderen ben je waarschijnlijk beter af met een purificatie van je DNA sample. phenol/Chloroform en alcohol precipitatie zou effectief moeten zijn. Alternatief kan je proberen om de hoeveelheid input materiaal te verminderen, door je sample eerst 10-50x te verdunnen.

Reageer